基于网络药理学研究黑豆方主要药物治疗湿疹的作用机制
2021-04-24刘绿野王钰菁耿立东
曲 尧 范 玉 刘绿野 王钰菁 张 洁 耿立东
1.山东中医药大学第一临床医学院,山东济南 250014;2.山东中医药大学附属医院皮肤科,山东济南 250014;3.山东中医药大学中医学院,山东济南 250014
湿疹是由多种内外因素引起的一种具有明显渗出倾向的临床常见的皮肤炎症性疾病,病因目前尚不明确,具有皮疹多型、多对称发生、自觉奇痒、病程缠绵反复的特点,严重影响患者的生活质量。在中医学中湿疹属于湿疮范畴,以清热利湿止痒为主要治法[1]。黑豆方为山东中医药大学附属医院皮肤科临床协定方,在临床治疗中取得了较好效果。本研究选用黑豆方中的6味主要药物:黑豆、马齿苋、地骨皮、黄柏、白鲜皮、白及,基于网络药理学的相关方法,发掘新的疾病相关的潜在治疗靶点,并探索其分子作用机制。
1 资料与方法
1.1 数据库及软件
中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP,Version2.3)[2-3],药物靶标数据库(DrugBank,Version5.1.5);GeneCards(Version 4.13),在线人类孟德尔遗传综合数据库(OMIM);蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络平台STRING(Version 11.0);UniProt蛋白质数据库[4];京都基因和基因组数据库(KEGG,Release 93.0)[5];R软件(Version 3.6.2);Cytoscape(Version 3.7.2)。
1.2 获取药物成分的筛选及靶点
通过TCMSP数据库搜索6味中药的中文名称,对口服生物利用度(OB)和类药性(DL)设定数值(OB≥30%,DL≥0.18)作为筛选条件[6]。获得药物的化学成分并通过DrugBank数据库获得各成分信息。
1.3 获取湿疹相关基因及靶点信息
在GeneCards数据库中检索“eczema”,在OMIM数据库中检索“weeping dermatitis”,获得湿疹相关基因。在UniProt蛋白质数据库中检索“Homo sapiens”获得人类蛋白质-基因表达信息。
1.4 筛选交集基因
参照UniProt蛋白质数据库获得的人类蛋白质-基因表达信息,处理数据,得到药物-成分-靶点-基因之间的对应关系,并通过R绘制韦恩图[7],获得药物与湿疹的交集基因。……
