SMARCAD1对胃癌患者的预后价值及其功能的生物信息学分析
2021-04-23曹会沈赟张玮谢怡萍
曹会 沈赟 张玮 谢怡萍



摘要:目的:利用生物信息学分析SMARCAD1与胃癌患者预后之间的关系,并预测其是否参与胃癌的发生发展及其所涉及的功能。方法:从GEO数据库中下载表达谱基因芯片数据GSE84437(包含433例胃癌样本),利用R编程软件分析绘制患者的生存曲线并筛选出SMARCAD1差异表达的样本,获得其中差异表达基因且绘制出聚类分析热图和火山图;利用METASCAPE进行GO功能富集;利用STRING构建目的基因蛋白互作网络。结果:通过R编程软件分析高表达SMARCAD1的患者总体生存率和无进展生存率均高于低表达组,独立预后分析和临床相关性分析结果显示SMARCAD1可独立于其他临床因素影响胃癌患者的预后,且对于胃癌是一个低风险因子;GO功能富集分析发现和SMARCAD1相關的差异表达基因主要和细胞外基质组织、白细胞迁移等活动有关。结论:高表达SMARCAD1的胃癌患者预后较好,SMARCAD1的表达可能是胃癌患者生存时间增加的预测因子。此外,SMARCAD1可能通过介导DNA损伤修复及基因组稳定在胃癌的发生发展中发挥重要作用,并有望成为判断胃癌患者预后的重要的生物学指标。
关键词:SMARCAD1;胃癌;生物信息学分析;预后
【中图分类号】R246.5 【文献标识码】A 【文章编号】1673-9026(2021)03-060-02
胃癌死亡率在全球癌症中排名第三位,其发病率也位于前列,在中国每年有近46万人被确诊,发病率居所有恶性肿瘤的第3位[1]。胃癌早期通常无症状或伴有非特异性症状,大约80%的患者被确诊时已为晚期[2],患者预后较差,平均5年生存率不到20%[3]。因此其早期筛查诊断是提高胃癌患者生存率和预后的重要保障[4]。……
