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MDMPR:小鼠发育代谢表型库

2021-04-22朱文静刘志玮

遗传 2021年4期
关键词:小鼠数据库资源

朱文静,刘志玮

资源与平台

MDMPR:小鼠发育代谢表型库

朱文静,刘志玮

苏州大学,剑桥–苏大基因组资源中心,苏州 215123

小鼠发育代谢表型库(Mouse Developmental and Metabolic Phenotype Repository, MDMPR)是一个致力于小鼠资源和表型数据实时共享的开放性平台,它依托于科技部重点研发计划“发育编程及其代谢调节”专项项目“建立小鼠发育代谢表型库”。该项目预计在5年内完成500个发育代谢相关小鼠敲除模型的建立,并对其表型数据进行标准化的解析、建立表型数据库。MDMPR作为一个资源及数据集成的库,由多个子系统作为支撑,包括ES细胞数据库、项目管理系统、繁育管理系统、精子库管理系统、表型分析系统,信息化管理深入到项目中每个环节,从基因突变ES细胞制备、基因突变小鼠制备、小鼠繁育,精子冻存到最终的表型分析、数据处理及展示,保证了MDMPR产生数据的真实性及实时性。MDMPR除了不断地推进项目进行,增加自身产生的数据外,也在积极的整合其他的资源及数据,如人特异性基因敲除ES细胞库、蛋白相互作用数据库(STRING)、核心转录调节环路(dbCoRc)和Enhancer-Indel数据库,今后还将进一步整合,帮助发育代谢及其他领域的研究人员能够一站式的获取所需资源和数据、加快研究进程,最终服务于全人类的医疗事业。

小鼠发育代谢表型库;资源库;开放共享平台

作为哺乳动物,小鼠()和人()的基因组同源性高达90%以上,在组织结构和功能、生理学稳态、生殖、行为和疾病发生机制等方面也高度相似。更重要的是,临床疾病大多有其遗传基础,基因突变小鼠模型可以真实模拟人类基因组变异导致的疾病,是研究病理机制和发现潜在靶标的最佳模式动物。……

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