基于网络药理学探讨野生砂生槐生物活性机制
2021-04-17赵年寿魏彦明武凡琳拉巴次旦吴金措姆马兴斌华永丽姚万玲
赵年寿,纪 鹏*,魏彦明,武凡琳,拉巴次旦,吴金措姆,马兴斌,华永丽,姚万玲
(1.甘肃农业大学 动物医学院,甘肃 兰州 730070;2.西藏自治区农科院畜牧兽医研究所,西藏 拉萨 850009)
砂生槐(Sophoramoorcroftiana, SM)在西藏又被称之为“狼牙刺”和“藏蓟”,豆科槐属植物,多年生矮灌木,为该地区重要野生植物资源之一。砂生槐提取物具有良好的抗寄生虫、抗病毒、抗肿瘤、抑菌等药理活性[1],但目前对其化学成分的生物功效物质基础、作用靶点及效用机制的相关研究尚不明确,因此有必要对其化学成分的作用机制进行探讨和研究。
网络药理学作为一门融入多学科的交叉学科,涉及多种学科,如系统生物学、高通量筛选和网络分析技术等[2],与中医药的整体性和系统性相一致,能对多成分、多靶点、多通路进行整合,适用于药物潜在生物活性的研究[3-5],有助于临床靶向药物的筛选及研究。因此,本研究就基于成分-靶点-通路的网络药理学探讨野生植物砂生槐的药用物质基础、作用靶点及生物活性作用机制,为野生砂生槐药用价值的深入开发奠定良好基础。
1 方 法
1.1 软件与数据库
PubChem数据库(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov);PharmMapper数据库(http://www.lilab-ecust.cn/pharmmapper);Uniprot数据库(https://www.uniprot.org/uniport);STRING数据库(https://string-db.org/);DAVID数据库(https://david.ncifcrf.gov/);Cytoscape 3.7.0软件;ChemDraw 17.1.0软件;R 3.6.3软件。
1.2 砂生槐化学成分收集
CNKI数据库中检索与“砂生槐”相关的关键词,从文献中筛选出经核磁共振和质谱等分析手段确认的化学成分,获取的化学成分结构在ChemDraw 17.1.0软件Search选项Find structure from name at ChemACX.Com中获取,并在PubChem数据库中对获取的结构式进行确认。
1.3 砂生槐化学成分潜在靶点预测及基因名标注
利……
