太湖流域地方猪种遗传结构评估和体重体尺性状差异相关选择位点鉴定
2021-04-13刘晨曦侯黎明周五朵徐燕尹彦镇周天威李平华黄瑞华
刘晨曦,侯黎明,周五朵,徐燕,尹彦镇,周天威,李平华*,黄瑞华*
(1.南京农业大学养猪研究所,江苏 南京 210095;2.南京农业大学淮安研究院,江苏 淮安 223005;3.江苏省畜牧总站,江苏 南京 210036)
中国太湖流域地方猪种包括二花脸猪(EHL),梅山猪(MS),枫泾猪(FJ),米猪(MI),嘉兴黑猪(JXB),沙乌头猪(SWT)和红灯笼猪(HDL)。其中,梅山猪根据体型大小分为中型梅山猪(MMS)和小型梅山猪(SMS)两个亚群[1]。这些猪种均具有耐粗饲,优秀的肉质和出色的繁殖性能[2-4],为商品猪的持续选育提供了宝贵的遗传资源[2]。
太湖流域地方猪独特的表型,意味其可能具备独特的遗传结构。Chen等[5]研究发现,太湖流域地方猪各品种及梅山猪品种内两个亚群在聚类模式上可以相互区分,说明各个群体间的遗传起源上独立,结构并不完全一致[5-7]。并且发现米猪和二花脸猪之间遗传关系更为接近[6]。
研究人员利用太湖流域地方猪种鉴定到多个与体重体尺相关的候选基因(QTLs),SUN等[8]在梅山猪两个亚群中鉴定到SPDEF,PACSIN1等与体重相关的基因在这两个亚群间受到不同方向的选择,用皮特兰和梅山猪杂交的F2代群体,鉴定到3号染色体影响日增重的QTL[9],以及影响该F2代群体的生长性状和胴体性状的FTO基因[10]。已有研究对象没有涵盖该地区地方猪种现存的全部血统,并且关于太湖流域地方猪各品种及梅山猪品种内两个亚群间体重体尺差异的遗传机制的研究不充分,没有利用其他遗传结构接近但体型差异显著的猪种进行验证分析。为了解决以上问题,本研究采集了440头代表太湖流域地方猪最全面血统的猪群样本,利用猪50 K芯片获得每个样本的基因分型数据,对基因分型数据集进行群体结构分析和选择位点鉴定。……
