包汝娟，陈慧芳，董 宇，叶幼琼，苏 冰

上海交通大学医学院上海市免疫学研究所，上海200025

结直肠癌（colorectal cancer，CRC）是最常见的恶性肿瘤之一，发病率和死亡率均较高［1］。目前，CRC 患者的预后主要取决于诊断时的疾病进程和肿瘤分期［2］。然而，由于缺乏适当的诊断方法，预后指标并不能满足实际的临床需求［3］。因此，开发能够有效预测患者预后的评价指标十分必要。目前，以靶向程序性死亡受体-1（programmed death-1，PD-1）为代表的免疫检查点抑制剂是CRC 免疫治疗的主要研究方向，但仅有一小部分CRC 患者受益，且在其他癌症中免疫治疗也并非适合于所有患者［4-5］。因此，找到能够预测癌症患者免疫治疗效果的关键特征基因，将有助于指导癌症的临床治疗。近年来，随着微阵列技术［6］和RNA 测序技术的飞速发展，由此产生的转录组数据成为了探索疾病机制、挖掘各类疾病预后标志物的丰富来源［7-9］。因此，整合来源于不同技术平台的数据集，将会为全转录组水平分析肿瘤相关异常基因提供更综合的数据基础。

因此，本研究利用生物信息学技术整合公共数据库的CRC 数据集，对CRC 预后相关的关键基因进行筛选并构建模型，评估模型的预测性能，探索模型在预测免疫治疗效果方面的应用，为CRC 患者的预后管理和个体化精准免疫治疗提供参考。

1 资料与方法

1.1 CRC相关数据的获取及整理

RNA-seq 数据集：①从基因型-组织表达（genotypetissue expression，GTEx）数据库（https：//commonfund.nih.gov/gtex）中下载308例正常结直肠组织样本的基因表达数据及对应的捐赠者临床信息（包含捐赠者……