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非小细胞肺癌组织SNORA56基因性状分析及临床样本验证

2021-04-07林升华王旖婷蒋金霞苏芸萱李世康

暨南大学学报(自然科学与医学版) 2021年2期
关键词:肺癌水平分析

林升华,王旖婷,蒋金霞,苏芸萱,李世康*

(1.广西医科大学 第一附属医院 胸外科,广西 南宁 530000; 2.桂平市人民医院 心胸外科,广西 桂平 537200; 3.桂平市人民医院 检验科,广西 桂平 537200)

肺癌是世界上发生率和死亡率最高的恶性肿瘤,我国肺癌五年生存率为19.8%[1].肺癌依据组织学分类可分为小细胞肺癌(small cell lung cancer,SCLC)和非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC).NSCLC主要包括肺鳞状细胞癌(lung squamous cell carcinomas,LUSC)和肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD),LUSC占所有肺癌的30%~35%,以中央型肺癌为主.LUAD约占35%~40%,是非吸烟患者中发生率最高的类型,腺癌以周围型多见,中央型也可见到.NSCLC占肺癌发生总数的85%,死亡率达80%~90%[2],大约70%患者确诊时已处于晚期,失去手术机会.肺癌晚期患者的5年生存率低于15%,肺癌早期患者通过合理治疗,5年生存率可高达80%,NSCLC患者即使处于进展期,在行肺癌根治术后结合其他合理辅助治疗,其5年生存率依旧可达35%~50%[3].NSCLC的早期发现、早期治疗对提高患者5年生存率至关重要.已有临床试验证实痰液中snoRNA检测对诊断肺癌有74.6%的敏感性和83.6%特异性[4].然而snoRNA种类繁多,最近发现的SNORA56在肺癌组织中的表达异常及其基因性状不明,目前仍缺乏这方面的研究.本研究通过癌症基因组图谱 (the cancer genome atlas, TCGA) 公共数据集并结合临床样本, 探究SNORA56在肺癌组织中的表达,分析其在NSCLC诊断及患者预后的影响,探索其基因性状,验证此性状的可重复性,分析SNORA56表达与NSCLC患者临床相关数据的关系,评估SNORA56表达量对NSCLC患者的诊断、预后的价值,并通过基因富集分析寻找SNORA56影响肺癌发展的可能通路.

1 材料与方法

1.1 数据收集

从SNORic数据库 (http:// bioinfo.life.hust.edu.cn/SNORic/) 下载……

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