APP下载

姜黄素治疗甲状腺乳头状癌的药理学作用机制研究

2021-04-03罗剑波余济春

中国保健营养 2021年34期
关键词:数据库分析

罗剑波 余济春

1. 南昌大学,江西 南昌 330006;2. 新余市人民医院,江西 新余 338000 3. 南昌大学第二附属医院,江西 南昌 330006

姜黄素在甲状腺癌等癌症治疗中可通过抑制癌细胞的增殖和迁移等而达到癌症治疗目的[1]。但姜黄素治疗甲状腺癌的的具体作用机制尚未明确。因此,本研究以网络药理学为基础,寻找其作用靶点和涉及的信号通路,探究黄素治疗甲状腺癌的具体作用机制,现报道如下。

1 资料与方法

1.1姜黄素作用靶点的预测 采用TCMSP 数据库、检索词Curcumin检索得到姜黄素相关靶点蛋白名称,并通过Uniprot 数据库转换为相对应的基因名称。PubChem 数据库中找出姜黄素的smile号和3D 结构(保存为SDF模式),在Swiss Target Prediction平台中输入该smile号预测姜黄素的靶点。3D结构SDF模式文档上传至 PharmMapper 服务器行姜黄素靶标预测、分析,靶点预测结果根据Fit score排序,从高到低,其中fit score>3的靶标为备选靶标。将得到的所有靶点进行合并去重,最终得到姜黄素的作用靶点。

1.2甲状腺癌相关靶点的收集 TTD、OMIM 数据库以Thyroid tumor和Thyroid carcinoma为检索词检索甲状腺癌相关靶点,获得的相关靶点蛋白名通过Uniprot数据库转换成基因名,剔除非人类基因。通过pharmgKB数据库以Thyroid tumor和Thyroid carcinoma为检索词检索甲状腺癌相关靶点。将各数据库获得靶点进行合并去重,并与姜黄素作用靶点映射,找出两者的共有靶点即为姜黄素治疗甲状腺癌的直接靶点。

1.3构建姜黄素相关靶点及其相互作用蛋白的PPI 使用Cytoscape 3.7.1 下的插件 BisoGenet 4.0.0,构建黄素相关靶点及其相互作用蛋白的PPI。导入姜黄素的相关靶点。

1.4构建甲状腺癌相关靶点及其相互作用蛋白的PPI 使用Cytoscape 3.7.1下的插件BisoGenet 4.0.0,构建甲状腺癌相关靶点及其相互作用蛋白的PPI。操……

登录APP查看全文

猜你喜欢

数据库分析
隐蔽失效适航要求符合性验证分析
电力系统不平衡分析
数据库
数据库
电力系统及其自动化发展趋势分析
数据库
数据库
数据库
中西医结合治疗抑郁症100例分析
在线教育与MOOC的比较分析