赵琳 何章彪 张欣 曹翠萍

(1商丘医学高等专科学校，河南 商丘 476000；2南阳医学高等专科学校)

鼻咽癌(NPC)是鼻咽上皮的恶性肿瘤，在东南亚和中国比较普遍〔1，2〕。在流行区，早期NPC患者的5年生存率达95%，晚期NPC患者的生存率仅为60%，70%的初诊NPC患者的病情会进一步发展〔3〕。因此，寻找潜在的识别早期NPC患者的生物标记物对改善患者预后具有重要意义。EB病毒(EBV)DNA检测目前用于NPC早期患者的筛查，但其对肿瘤筛查的阳性预测值较低(11%)〔4〕。有证据表明，基因和细胞信号通路，可能参与NPC的发生和发展，包括TGF-β信号通路和Notch信号通路〔5〕。NPC进展的分子机制尚不清楚，目前对NPC的早期诊断和治疗有限〔6〕。因此，需要进一步研究NPC发生和发展的分子机制。

基因芯片是分析基因表达的高通量平台，可以鉴定参与各种信号通路、分子功能和生物学过程的数百个差异表达基因(DEGs)〔7〕。本研究从基因表达综合数据库〔GEO；www.ncbi.nlm.nih.gov/geo；GPL570(HG-U133_Plus_2)Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array〕上下载了GSE64634数据，以鉴定NPC组织中的DEGs〔8〕。随后，进行了基因本体论(GO；www.genontology.org)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析，以确定关键基因的生物学功能和通路〔9〕。这项研究的结果为NPC的潜在生物标志物提供了新的见解，并可能有助于对NPC发生和发展的分子机制的理解。

1 材料和方法

1.1研究工具和对象 基因表达谱GSE64634从GEO数据库下载。GSE64634是在Affymetrix GPL570平台〔GPL570(HG-U133_Plus_2)Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array〕的基础上提出的，由12例NPC标本和4例正常对照(GSM1575894，GSM1575895，GSM1575896，GSM15-75897)组成。应用在线分析工具GEO2R(https：//www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/geo2r/)对NPC及对应的癌旁组织进行DEGs分析。GEO2R是一个基于R语言程序的数据集分析工具，能够对相同实验条件下的两组样品进行对比，筛选DEGs。……