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基于流式细胞术的舟山泽陆蛙基因组大小测定

2021-03-31王伊宁徐晓晖金园庭翟韵萍

关键词:物种标准

王伊宁,徐晓晖,2,金园庭,翟韵萍,邵 罡

(1.中国计量大学生命科学学院,浙江杭州 310018;2.中国计量大学现代科技学院,浙江杭州 310018)

泽陆蛙Fejervarya limnocharis,属无尾目Anura,叉舌蛙科Dicroglossidae,陆蛙属Fejervarya,它是我国南方蛙类优势种之一,广泛分布于稻田、沼泽、森林等环境[1]。它又称稻米蛙,在稻田生态系统中是优势甚至唯一的蛙类,维持泽陆蛙种群数量对维护农业生态系统的健康,以及病虫害的生物防治有重要意义。然而,由于人类干扰,以及农药的过度使用,泽陆蛙数量急剧减少,开展泽陆蛙的遗传保护研究对日后开展其科学的种群保护意义重大。舟山泽陆蛙与大陆地区的泽陆蛙种群形成了线粒体进化的两大分支,且与日本分布的泽陆蛙种群亲缘关系更近,具有遗传分化研究的重要意义[2],目前我国对泽陆蛙的研究报道还很少。

基因组大小(C-值)是指一个生物的单倍体DNA 含量,它是开展基因组高通量测序研究必须首先要考虑的一个重要指标。在真核生物中,每个物种的单倍体基因组DNA 总量是高度恒定的,每个物种各有其特定的基因组大小,C-值可作为每个物种的一个特异性参数[3]。

目前,随着科学技术的不断发展,出现了多种测定基因组大小的方法,如流式细胞术、荧光定量分析法、孚尔根染色-显像密度计法、孚尔根染色-图像分析法等,其中流式细胞术是一种利用激光束散射与折射原理来对液体中的细胞或其他微小颗粒状物体进行快速分析与分选的技术,可以高通量分析上万个细胞,具有速度快、精度高、准确性好的优点[4],它近年来常被用来测定DNA 的含量[5-8]。……

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