张 梅，杨加文，龙成昌，周 艳，王 永

(贵州省植物园，贵阳550004)

随着DNA测序技术等各项分子生物学研究手段的不断完善与成熟，利用叶绿体基因组序列与核基因组序列信息构建系统发育关系目前已经成为植物系统学研究的热点和主要手段，它向我们揭示了许多以往传统方法无法发现和难以解决的问题。目前，利用分子系统学手段来得到更自然的系统演化关系已成为有效且普遍的途径[1-3]，随着测序技术的进步和系统演化算法的发展，越来越多的植物类群在分子水平上陆续开展了工作，利用核基因和叶绿体DNA片段序列进行植物类群的分子系统学研究，能够更加客观地显示其系统发育关系。

核基因组ITS序列(5.8S rDNA和28S rDNA 基因间隔序列，也称为内部转录间隔区，即Internal Transcribed Spacer，简称ITS)已成为植物分子系统学研究中应用最为广泛的DNA片段之一。一方面由于ITS在核基因组中的高度重复性，同时这些重复单位已发生了质同进化(concerted evolution)[4]；另一方面由于其引物是通用引物，这些特性为测序工作提供了极大的方便。已有资料表明被子植物ITS长度通常为565～700 bp变异幅度很窄，并且无一例外地小于700 bp[5]。ITS序列大小只需用扩增时的1对引物即可进行全序列测定，使该序列在探讨被子植物属下水平的系统分类与进化的研究中得到广泛应用[6-10]。ITS序列表现的变异水平比较适合于属间、属下和种间等分类单元的系统学研究，或有时也用于科、亚科、族内的系统发育研究[6,11-21]。叶绿体基因组(cpDNA)为闭环结……