卢 鹏，金静静，曹培健，许亚龙，李泽锋

中国烟草总公司郑州烟草研究院，郑州高新技术产业开发区枫杨街2 号 450001

近年来，随着高通量植物表型数据获取技术的广泛应用和植物表型数据的快速积累，逐步形成了以植物表型组学数据为基础、以多学科交叉分析技术为手段的大数据体系，并在植物表型大数据的数据获取、数据存储管理以及数据分析应用等方面取得了较快的研究进展，利用表型大数据开展植物育种尤其是为作物进行智能辅助育种已逐渐成为研究热点。为及时了解植物表型大数据相关技术的发展，跟踪植物表型大数据的研究前沿与热点，回顾了植物表型组学的相关概念，并对植物表型组学大数据的研究进展，尤其是对其在育种方面的应用进行了梳理，同时关注了烟草表型大数据的产生和发展过程，并对该领域今后的发展作了展望。

1 植物表型组学大数据发展概况

在植物学和遗传学研究领域，特别是在作物育种领域，表型（Phenotype）是一个使用非常广泛的术语，该术语来源于希腊词语Phainein 和Typos的组合。在1911 年“表型”这一术语被Johannsen首次定义为“可通过直接观察或精细测量进行描述区分的生物属性”［1］。表型组（Phenome）则在1949 年被Davis 首次定义为“细胞中所有非遗传性、非自复制部分的总和，是所有表型的集合”［2］。20 世纪90 年代，人类基因组、转录组以及遗传疾病关联分析等各类研究的开展促进了相关理论的不断发展，1997 年，Schork 等［3］首次在疾病研究中提出了表型组学概念。……