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高效非损伤性扇贝DNA提取方法的建立及效果评价❋

2021-03-23张天琦刘平平黄晓文张嘉俊

中国海洋大学学报(自然科学版) 2021年5期
关键词:检测方法

张天琦,刘平平,吕 佳❋❋,马 岑,黄晓文,张嘉俊,王 师,2

(1.中国海洋大学海洋生命学院,海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室,山东 青岛 266003;2.青岛海洋科学与技术试点国家实验室,海洋生物学与生物技术功能实验室,山东 青岛 266071)

贝类是海洋生态系统的重要底栖动物类群,同时也是我国海水养殖产业的重要养殖种类。近些年迅速发展起来的分子标记技术,在贝类的遗传学研究以及贝类种质创新和新品种培育等方面发挥了重要作用[1-3]。特别是简化基因组测序技术的出现可高效获得全基因组范围的标记信息[4-7],使实现贝类全基因组选育成为可能[8]。在贝类遗传学研究中,有时需要在保持贝类活体状态的情况下开展,如对珍稀濒危贝类的保护遗传学研究。此外在贝类分子育种实践中,常常需要在不影响扇贝生存或正常生理状态的前提下,对大规模育种群体进行基因组DNA提取,用于后续基因型测定分析,因此开发高效、简便快速的非损伤性DNA提取方法对贝类全基因组选育的开展以及珍稀濒危贝类的遗传学研究具有重要的意义。

贝类基因组DNA提取方法大致可以分为以下几类:第一类是以酚氯仿抽提法[9]或商业试剂盒(如E.Z.N.A. Mollusc DNA Kit (Omega Bio-tek)、TIANamp Marine Animals DNA Kit))为代表的DNA提取方法,由于需要较大的入口组织量(大于10 mg),取材通常是致死性的;第二类是损伤性较低的取样方法,例如剪取少量外套膜[10]、剪取鳃丝[11]、抽取血淋巴[12]等方式,虽然不会导致实验对象死亡,但往往会对其造成不同程度的损伤,比如感染、畸形等[13];……

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