基于高通量测序的结直肠癌组织中环状RNA 功能研究与预后分析
2021-03-19傅中懋戎泽印章建明李腾飞余志龙
傅中懋,罗 再,戎泽印,章建明,李腾飞,余志龙,黄 陈
上海交通大学附属第一人民医院普外科,上海200080
结直肠癌是当今世界最常见的恶性消化道肿瘤之一,每年新增结直肠癌患者人数为185 万,新增死亡人数为88 万[1]。在美国,结直肠癌的发病率与病死率在男性和女性罹患的恶性肿瘤中均排第三[2]。据我国肿瘤中心登记的数据显示,2015 年结直肠癌在总新发肿瘤中发病率与病死率均排第五[3]。结直肠由可治愈的局部恶性病变发展到转移性结直肠癌需要经过一个漫长的时间窗,因此早期诊断的意义重大。目前,结直肠癌检查主要为直肠指诊和结肠镜检查。由于侵入式检查会给患者带来不适感,患者往往不愿意定期检查[4]。计算机断层扫描检查虽然为非侵入性,但由于其局限于形态成像,可能会将残余粪便误诊为肿瘤而导致假阳性结果[5],因此血源性生物标志物被认为是一种侵入性最小的选择。近年来,癌胚抗原(carcinoembryonic antigen,CEA)、糖类抗原19-9(carbohydrate antigen 19-9,CA19-9)、CA242 等已被证实与结直肠癌的诊断和预后相关[6]。但是这些指标的特异性往往有所欠缺,例如在其他恶性肿瘤如卵巢癌、胰腺癌,甚至在良性疾病如炎症性肠病中,CEA 的水平也会升高[7]。因此为了改善患者预后,深入研究结直肠癌的发生机制,挑选新型生物标志物至关重要。
随着二代测序技术与生物信息技术的发展,人们对环状RNA(circular RNA,circRNA)的研究与认识越发深入。circRNA在哺乳动物中普遍存在,作为一种不具有5'端帽子结构和3'端多腺苷酸尾部结构的特殊环状闭合RNA,其结构稳定,不易被核酸外切酶降解[8]。……