黑果枸杞基因组SSR标记开发及遗传多样性分析
2021-03-04黄兴发赵建华姚佳依秦小雅汪淑芬曹有龙战祥强
黄兴发,尹 跃,,赵建华,姚佳依,秦小雅,汪淑芬,曹有龙,战祥强
(1西北农林科技大学 园艺学院,陕西 杨凌 712100;2宁夏农林科学院 国家枸杞工程技术研究中心,宁夏 银川 750002)
黑果枸杞(LyciumruthenicumMurr.)系茄科(Solanaceae)枸杞属(Lycium)多年生落叶多棘刺灌木植物,主根系发达,具有较强的抗旱性和耐盐性[1-2],主要分布在我国新疆、青海、甘肃、宁夏等西北地区盐碱地、沙漠、路边等,是西北地区水土保持的先锋树种[3],其果实富含丰富的花青素和多酚物质,具有抗氧化、抗衰老等功效[4-8],已成为当前国内外研究的热点领域。近年来,国家枸杞工程技术研究中心收集保存了黑果枸杞种质资源,但这些资源遗传背景复杂,限制了黑果枸杞的品种选育和产业发展。因此,加强黑果枸杞种质资源遗传多样性分析及遗传图谱构建等研究,对黑果枸杞新品种选育及产业发展具有重要意义。
简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)又称为短串联重复(short tandem repeats,STR)或微卫星DNA(microsatellite DNA),广泛存在于真核基因组中。SSR标记因具有共显性、多态性高、高通量数据易处理及易共享等优点[9],已广泛应用于山茶、白蜡等植物遗传多样性评价、核心种质和遗传图谱构建及重要性状定位等研究领域[10-15]。近年来,随着高通量测序技术和生物信息学技术的快速发展,大规模植物已完成全基因组测序[16],人们基于全基因组测序数据开发了大量的SSR标记,且建立了SSR标记检索数据库[17-19],为SSR标记的利用提供了快捷的途径。而枸杞SSR标记开发及应用的研究相对滞后,目前已从红果枸杞中开发了一批多态性高的SSR标记,并应用于品种鉴定、分子指纹图谱构建及遗传多样性评价研究[20-26]。……