阿曼古丽·斯拉依，赵卫东，王进香，赵建国，黄 燕，韩先干，王 旭，龚海燕，米荣升，陈兆国

（1.中国农业科学院上海兽医研究所 农业农村部动物产品质量安全生物性危害因子风险评估实验室（上海）农业农村部动物寄生虫学重点实验室，上海200241；2.新疆伊犁州动物疾病控制与诊断中心，伊宁8350993；3.宁夏回族自治区动物疾病预防控制中心，银川750011；4.海南大学生命科学与药学院 教育部热带生物资源重点实验室，海口 570228）

隐孢子虫（Cryptosporidium spp）是一种重要的人兽共患寄生性原虫，可以通过污染了卵囊的水或食物进行传播，能够引起人和动物腹泻。隐孢子虫在全世界范围内均有报道，各个年龄阶段均可感染，儿童和幼龄动物更易感，严重的可以造成死亡[1]。

传统的隐孢子虫检测方法是对粪便样品进行染色或饱和蔗糖漂浮，然后用显微镜进行镜检。但是，很多隐孢子虫形态学非常相似，仅利用常规的显微镜检技术无法鉴别虫种，而使用PCR扩增结合测序方法，能够鉴定感染的虫种或基因型[2]。当前，应用分子检测方法，已经鉴定的隐孢子虫虫种多达30多种。虽然并不是所有虫种均可以感染人[3]，但有必要对动物感染的隐孢子虫进行虫种鉴定，弄清感染的虫种或基因型，这对于制定有效的防控措施具有重要的意义。

伊犁河谷位于新疆西北部，河谷内北、东、南三面环山，自东向西敞开为“U”形谷地，属于温带大陆性气候，气候温和湿润，素有“天山湿岛”之称[4]。伊犁河谷区域包括伊犁州八县两市，具有得天独厚的草地畜牧业条件，天然草地面积占河谷土地总面积的60.9%，畜牧业是伊犁河谷最具优势的产业之一[5]。……