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四川山胡椒叶绿体基因组特征及山胡椒属系统发育*

2021-02-12唐利洲韩利红

林业科学 2021年12期
关键词:物种

刘 潮 唐利洲 韩利红

(曲靖师范学院生物资源与食品工程学院 云南省高校云贵高原动植物多样性及生态适应性进化重点实验室 云南省高校特色果酒技术创新与应用工程研究中心 曲靖 655011)

四川山胡椒(Linderasetchuenensis)为樟科(Lauraceae)山胡椒属(Lindera)常绿灌木,多生于山坡路旁及疏林中,分布于我国四川、贵州等地(http:∥www.iplant.cn/frps)。四川山胡椒叶片提取物香精油对金黄色葡萄球菌(Staphylococcusaureus)、白色念珠菌(Candidaalbicans)和大肠杆菌(Escherichiacoli)均具有明显的抑制作用(Weietal., 2016),其叶片中提取的多种化合物具有抗肿瘤活性(袁娟娟, 2018; 张嘉穗, 2016)。

叶绿体是质体的一种,为绿色植物光合作用的场所,具有相对独立的遗传系统。陆生植物叶绿体基因组大小范围为107~218 kb,具有高度保守的四分体结构,包括2个反向重复区(inverted repeats,IR),以及被IR分隔的大单拷贝区(large single copy,LSC)和小单拷贝区(small single copy,SSC)(Danielletal., 2016)。叶绿体基因组编码120~130个基因,主要参与光合作用、基因转录和翻译(Danielletal., 2016)。目前多个山胡椒属物种叶绿体基因组已被相继报道(Songetal., 2020; Zhaoetal., 2018; Tianetal., 2019)。完整的叶绿体基因组序列对于了解植物相近类群之间的系统发育关系和物种进化具有重要价值(Danielletal., 2016),基于高通量测序的系统进化基因组学研究,成为全面理解生物进化的重要工具(Songetal., 2020)。叶绿体基因组数据已经很好地解决了樟科等多种植物类群的系统发育关系(Songetal., 2017; 2020; Zhaoetal., 2020; Xieetal., 2020)。密码子使用偏性可以反映叶绿体基因组进化特征及其影响因素,在基因表达中起重要作用(Boeletal., 2016)。叶绿体基因组条形码可用于品种鉴定和种质资源保护,物种特有的重复序列可以作为一种潜在的遗传多样性标记。……

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