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梅花鹿鹿茸快速生长期环状RNA鉴定及生物信息学1)

2021-02-10韩若冰李和平

东北林业大学学报 2021年12期
关键词:差异

韩若冰 李和平

(东北林业大学,哈尔滨,150040)

鹿茸的快速生长及其每年的周期性再生现象在哺乳动物中极为罕见。在梅花鹿鹿茸的快速生长期,其生长速度可达到12.5 mm·d-1[1],不仅如此,鹿茸的生长速度堪比癌细胞,却极少发生癌变,这些独特的生物学特性使得鹿茸受到研究者的广泛关注。了解鹿茸生长发育的分子调控机制对于鹿茸生物学的研究甚至是癌症治疗的进一步研究均具有重要的科学意义。

迄今为止,已有众多研究关注鹿茸生长发育的分子调控机制。随着高通量测序技术的迅速发展,选用梅花鹿鹿茸作为试验材料,从转录组水平上探究鹿茸生长发育的研究应运而生。通过对不同生长时期的梅花鹿鹿茸进行转录组测序,得到了几种可能对鹿茸生长发挥重要调控作用的转录因子:PER1、EGFR1、GAS1[2]。通过对骨化期梅花鹿鹿茸的转录组测序得到了Sp7、SOX4、MMP9、MMP13等30种与鹿茸软骨内骨化相关的基因[3]。然而关于非编码RNA在鹿茸生长发育过程中的研究还较为匮乏,主要集中于miRNA的研究,Yao et al.[4]通过高通量测序技术鉴定得到一些参与鹿茸软骨发生和软骨内骨化的miRNA(miR-3072-5p、miR-1600、miR-34-5p、miR-6889-5p、miR-6729-5p)。

环状RNA是一类在转录后水平具有重要基因表达调控作用的内源性非编码RNA[5-6],不具有5’末端及3’末端。近些年来已经成为1个新的研究热点。然而,对于鹿科动物中环状RNA的研究还较少。本研究运用高通量测序技术鉴定鹿茸2个生长发育时期(鹿茸生长前期、快速生长期)的环状RNA并进行生物信息学分析,试图挖掘对鹿茸生长发育发挥调控作用的环状RNA,旨在为梅花鹿的多组学研究及其生长发育机理的探究提供参考。……

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