王 蕊 施龙建, 田红丽 易红梅 杨 扬 葛建镕 范亚明 任 洁 王 璐 陆大雷 赵久然* 王凤格*

研究简报

玉米杂交种纯度鉴定SNP核心引物的确定及高通量检测方案的建立

王 蕊1,**施龙建1,2,**田红丽1易红梅1杨 扬1葛建镕1范亚明1任 洁1王 璐1陆大雷2赵久然1,*王凤格1,*

1北京市农林科学院玉米研究中心 / 玉米DNA指纹及分子育种北京市重点研究室, 北京 100097;2扬州大学 / 江苏省作物遗传生理国家重点实验室培育点 / 粮食作物现代产业技术协同创新中心, 江苏扬州 225009

纯度是玉米种子质量的重要指标之一, 尤其杂交种自交株是影响田间产量的关键因素。KASP (kompetitive allele specific PCR)技术具有高通量、低成本的优点, 适用于种子纯度检测。本研究基于12套杂交种及其父母本的三联体样本及335份玉米杂交种国家审定标准样品SNP指纹, 从384个SNP基础位点筛选获得60个候选位点, 位点转化为KASP引物的成功率为95%。综合考虑引物双亲互补率、多态性、稳定性和分型效果等多项指标, 最终确定20个引物作为玉米杂交种纯度鉴定的核心引物, 能够有效鉴定99.7%供试样品纯度。对于待测样品京科968通过SNP-DNA指纹数据库查询, 并选择双亲互补型引物进行纯度鉴定。在检测的110个个体中, 共检出1个自交苗和2个异型株, 纯度为97.3%。同时, 基于纯度核心引物对批量样品检测建立高通量纯度检测方案, 具有快捷、准确、高通量和低成本的特点, 为政府监管和企业提供了更多纯度鉴定方案的选择。

纯度; SNP; KASP; 玉米杂交种; 核心引物

玉米(L.)是世界上最早且最充分利用杂种优势进行生产的作物, 国内目前90%以上的玉米生产用种是单交种[1]。……