曲泽鹏，陈沫先，曹朝辉，左文龙，陈业，戴磊

（中国科学院深圳先进技术研究院，深圳合成生物学创新研究院，中国科学院定量工程生物学重点实验室，广东 深圳518055）

1 合成微生物群落

合成微生物群落是人工合成的多个物种共培养的微生物体系（包括野生型和基因组改造的微生物）［1-3］。微生物群落数量庞大、分布广泛，在自然生态系统中扮演着重要角色［4］。近年来，研究发现微生物群落与人体健康［5-6］、植物抗逆［7］息息相关，在天然产物生产、食品、酿造业、生物能源［8］、环境治理［9］等多个领域也有着重要作用。相比于单一菌株，微生物群落可以更好地适应环境变化，在代谢上分工协作，催化更为复杂的反应。合成微生物群落可以作为简化的模型系统，来研究微生物群落的结构和功能。随着DNA 测序技术的发展和测序成本的降低，关于微生物群落的研究不断增加［10］，但是我们仍然缺乏对微生物群落功能的分子机制和生态机制的理解［11］。合成微生物群落未来的研究方向，是运用建物致知、建物致用的理念和合成生物学、定量生物学的方法，对微生物群落进行精准的调控和改造，解决人类健康、农业生产等领域的重要问题。

合成微生物群落属于合成生物学和微生物组学的交叉领域，是新兴的研究方向。根据Web of Science 检索结果和统计分析发现，近十年来，合成微生物群落的相关文章逐年增加［图1（a）］。目前为止，在合成微生物群落研究领域，美国研究者发表的文章数量占比34.3%，中国研究者占比12.7%，位居第二［图1（b）］。……