贾 婕，冯源恒，杨章旗

（广西壮族自治区林业科学研究院 国家林业和草原局马尾松工程技术研究中心广西马尾松工程技术研究中心，广西南宁 530002）

马尾松（Pinus massoniana）是我国南方主要的乡土树种, 具有分布广、生长迅速和适应性强等特点,在森林资源和松脂产业发展以及森林生态服务功能等方面发挥着重要作用，在创造经济价值和发挥生态效应方面有重要地位[1]。随着马尾松育种研究的深入，越来越多的问题需要从分子机理上进行解析。由于马尾松尚未开展全基因组测序，基因组及转录组数据缺乏，其生长发育的相关研究、遗传多样性研究以及分子标记开发和遗传图谱构建等研究相对滞后[2]。

全基因组重测序是对已知基因组序列物种的个体进行基因组测序, 并在此基础上对个体或群体进行差异性分析的一项测序技术。利用全基因组重测序技术可以在全基因组范围内挖掘单核苷酸多态性（SNP）、插入缺失标记（InDel）、结构变异（SV）和基因拷贝数变异（CNV），其广泛应用于变异检测、遗传图谱构建、性状定位和群体进化研究等[3]，已经在玉米（Zea mays）[4-5]、水稻（Oryza sativa）[6]、油 菜（Brassica campestris）[7-8]和 辣 椒（Capsicum annuum）[9]等作物中得到了广泛应用。朱风丽等[10]将韩国赤芝（Ganoderma lucidum）重测序数据与中国赤芝CGMCC 5.0026 参考基因组进行对比，共发现10 607 个基因发生非同义SNP，4 774 个InDel 和1 428 个SV，并找到了与菌丝生长相关的候选基因。张国儒等[11]以基因组重测序为基础，检测出大量栽培型加工番茄（Lycopersicon esculentum）‘M82’和潘那利渐渗系‘IL71’两品系间差异的In-Del 标记位点，利用这些位点序列设计引物后，共检测出40 对特异性位点，为后期杂种种子纯度鉴定提供了依据。……