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塔里木兔线粒体基因组全序列分析与系统进化研究

2021-01-13黄娅琳徐燕红周用武侯森林

野生动物学报 2021年1期
关键词:物种

黄娅琳 黄 捷 时 玉 徐燕红 周用武 侯森林

(1.南京森林警察学院刑事科学技术学院,南京,210023;2.野生动植物物证技术国家林业与草原局重点实验室,南京,210023;3.广西壮族自治区森林公安局物证鉴定所,南宁,530028)

塔里木兔(Lepusyarkandensis),属于兔形目(Lagomorpha),兔科(Leporidae),兔属,又名莎车兔、南疆兔,为我国特有物种,仅分布于新疆塔克拉玛干沙漠塔里木盆地周围分散的绿洲及荒漠地带[1]。随着当地经济的发展、石油开采业的发展以及非法狩猎活动的增加,塔里木兔的数量急剧下降,于1989年被列为国家Ⅱ级重点保护野生动物。与其他受保护物种相比,塔里木兔受关注程度较低,相关遗传学研究较为匮乏。

mtDNA 在细胞中拷贝数多,没有基因重组现象,严格遵循母系遗传,其进化速率是单拷贝核基因的 5—10 倍,因此它是动物系统发育分析和物种识别的常用工具。本研究拟基于本研究组前期通过二代测序技术获得的塔里木兔线粒体全基因组序列[2],对其线粒体DNA全基因组序列结构特征及系统进化进行进一步研究,以期为研究其遗传多样性、分类地位,为保护塔里木兔这一我国特有的濒危物种奠定分子遗传学研究基础。

1 材料和方法

1.1 试验材料

塔里木兔样本于2019年2月采自新疆阿克苏库车县。样本采集后保存于南京森林警察学院DNA检验室标本库。通过Illumina MiSeq测序分析获得全长为17 011 bp的线粒体全基因组序列[3],该序列已提交NCBI基因数据库(GenBank 登录号:MN450151)。另有下载自NCBI的GenBank的12份兔属其他物种线粒体全基因组序列和2份外群物种鼠兔科(Ochotonidae)物种(高原鼠兔Ochotonacurzoniae和达乌尔鼠兔Ochotonadauurica)线粒体全基因组序列,实验材料信息详见表1。……

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