猫科动物冠状病毒感染情况调查及其基因的进化分析
2021-01-13杨德全鞠厚斌朱九超葛菲菲杨显超沈海潇赵洪进
杨德全 鞠厚斌 朱九超 葛菲菲杨显超 李 鑫 沈海潇 赵洪进 王 建
(上海市动物疫病预防控制中心,上海,201103)
冠状病毒(Coronavirus)属于巢状病毒目(Nidovirales)、冠状病毒科(Coronaviridae),为一种正义单链RNA病毒,根据其基因组结构及系统发生学分析,可分为α、β、γ和δ 4个属。α和β属冠状病毒可感染哺乳动物,而γ和δ属冠状病毒主要感染鸟类,少数也可感染哺乳动物[1]。冠状病毒有十分广泛的宿主种类,人(Homosapiens)、猪(Sus)、马(Equuscaballus)、牛(Bos)、鼠(Rattus)、犬(Canis)、猫科(Felidae)动物等,可通过不同机制进行跨种传播[2]。新型冠状病毒性肺炎(coronavirus disease 19,COVID-19)疫情发生以来,人与动物的安全已成为当今社会的公共卫生大事之一。现有研究表明,新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)来源于某种或某几种野生动物[3-4]。为了及时了解猫科动物感染新型冠状病毒(SARS-CoV-2)和猫冠状病毒(Feline coronavirus,FCoV)的情况,本研究采集上海某动物园的猫科动物样品进行冠状病毒检测,不仅可以了解冠状病毒在猫科动物的感染情况,而且对公共卫生及野生动物保护具有重要意义。
新型冠状病毒(SARS-CoV-2)属于冠状病毒亚科β属 B 亚群,其基因组具有典型的冠状病毒结构,基因组序列与蝙蝠源的冠状病毒同源性高达96%[5]。猫冠状病毒(FCoV)属于冠状病毒亚科α属,其基因组由1条长约29 000核苷酸的正链RNA组成。编码11个开放阅读框(ORFs):2个复制酶蛋白基因(pp1a和pp1ab)、4个结构蛋白基因(S、E、M和N)和5个附属蛋白基因(ORF3a-c和ORF7a,b)[6]。FCoV 可分为type I 和type Ⅱ两种血清型;猫肠道冠状病毒(feline enteric coronavirus,FECV)和猫传染性腹膜炎病毒(feline infectious peritonitis virus,FIPV)两种生物型,两种血清型在两种生物型中普遍存在[6]。FECV致病性低,引起轻度肠炎或无明显感染;FIPV毒力强,致死性强。……
