朱培雯,史学佳,秦士杰,廖 敏,马 飞

(1.安徽农业大学植物保护学院,安徽 合肥 230036)(2.南京师范大学生命科学学院,江苏 南京 210023)

宫颈鳞癌(CESC)是严重威胁妇女健康和生命的第二大常见的恶性肿瘤[1]. 目前,宫颈癌的发病率约为20%～30%,患者的预后也很差[1]. 由于缺乏可靠的诊断和预后标记,CESC患者的诊断和预后效果并不令人满意[2]. 因此,获取新的有价值的分子生物标志物对于提高CESC患者的生存率十分必要和紧迫.

MicroRNA(miRNA)是一类长约为22nt内源性小非编码RNA分子,可通过靶向它靶标mRNA的 3′UTR 从而在转录后水平上抑制翻译来参与许多生物学过程[3]. 长链非编码RNA(lncRNA)是长于200个核苷酸的非编码RNA,它可以通过顺式或反式作用等多种途径控制基因的表达[4]. 有趣的是,竞争性内源RNA(ceRNA)假设具有部分相似的mRNA序列的lncRNA可以作为miRNA内源海绵来影响其靶标mRNA的稳定性,特别是mRNA和lncRNA也可以共享一个或多个miRNA响应元件(MREs)在癌症的发病机理中发挥重要的调节作用[5-6].

以前的研究主要集中在差异表达基因或单个lncRNA和miRNA的靶标验证[7]. 迄今为止,CESC发生和发展相关的ceRNA的功能机制仍然非常有限. 值得注意的是,下调的lncRNA(MEG3和ADAMTS9-AS2)和上调的miRNA(hsa-MiR-144和hsa-MiR-96)可以形成各种ceRNA参与CESC的发生和发展[8]. 然而,这种ceRNA是否可以作为CESC患者生存的诊断和预后因子,有待进一步研究.

1 材料和方法

1.1 数据资源与处理

从癌症基因组图谱(TCGA)数据库(https://cancergenome.nih.gov/)下载了CESC患者miRNA、mRNA和lncRNA的去核糖体全转录组表达数据以及相应的临床信息. 除去总生存时间少于30 d的样本后,最终获得了总共273例CESC患者样本.

1.2 差……

登录APP查看全文