Ssc-miR-133a-5p的靶基因预测及其相关信号通路的生物信息学分析
2021-01-09常雪蕊赵志显赵俊金邓晓彬张永红倪和民王楚端
常雪蕊 ,赵志显 ,赵俊金 ,邓晓彬 ,刘 刚 ,张永红 ,郭 勇 ,倪和民 ,王楚端 ,邢 凯 *
(1.北京农学院动物科学技术学院,北京 102206;2.全国畜牧总站,北京 100193;3.北京田园奥瑞生物科技有限公司,北京100096;4.中国农业大学动物科学技术学院,北京 100194)
脂肪是机体能量贮存最主要的形式,脂类代谢在机体生命活动中发挥着至关重要的作用,而脂肪的代谢对于畜牧生产有重要意义。在畜禽生产中,脂肪对于维持生命活动、生长发育和生产是至关重要的。近年来,研究者以猪为试验对象进行了大量miRNA(小的非编码单链RNA)的研究,研究表明,miRNA参与调控脂肪细胞的分化、脂肪形成、脂肪酸代谢、胆固醇合成等多个生命过程[1,2]。目前有关调控猪脂肪代谢相关的miRNA研究十分欠缺。
许多miRNA已成为脂质代谢和胆固醇代谢的重要调节因子。例如,已经有研究确定了miR-33的功能,包括调节巨噬细胞激活和线粒体代谢猪脂肪发育相关。将miR-33识别为一种重要的非编码RNA,可独立于其在调节脂质代谢中的作用而控制心血管稳态[3]。例如miR-148a和miR-128-1,是靶向调节细胞胆固醇代谢的重要蛋白质,并有望治疗动脉粥样硬化在内的心脏代谢疾病[4]。
在猪的脂肪合成中,有实验证明miR-146a-5p能够抑制脂肪生成[5]。有研究发现miR-196a/b(miR-196a,miR-196b-5p)在皖南花猪中的表达水平最高,miR-196a/b通过一种新的途径影响猪背长肌中的脂肪发生脂肪细胞因子信号通路[6]。
目前,关于miR-133a的报道多集中影响细胞的增殖和分化,研究用于抑制癌症疾病的细胞增殖。例如下调miR-133a-3p对膀胱癌的肿瘤起抑制作用[7],miR-133a-5p会抑制成肌细胞的增殖和分化等[8]。……
