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沧州市汉族人群髓系肿瘤遗传易感性与TET2基因单核苷酸多态性相关性研究

2020-10-28张睿王澎李连连

健康必读·下旬刊 2020年10期
关键词:遗传

张睿 王澎 李连连

【摘 要】目的:观察沧州市汉族人群髓系肿瘤遗传易感性与TET2基因单核苷酸多态性相关性。方法:选择2019年1月-2019年12月至我院进行髓系肿瘤治疗的患者34例作为观察组,随机选择同一时期至我院体检健康志愿者100例作为对照组。所有患者均基于TET2基因单核苷酸检查。结果:两组参与研究人员的TET2rs2454206、TET2rs12498609基因型分布和位点等位基因频率均有明显差异,观察组TET2rs2454206、TET2rs12498609基因型AA基因型比例高于对照组,且无GG分型。结论:沧州市汉族人群髓系肿瘤遗传易感性与TET2基因单核苷酸多态性具有一定的相关性。

【关键词】髓系肿瘤;遗传;TET2;单核苷酸多态性

【中图分类号】R730.2 【文献标识码】A 【文章编号】1672-3783(2020)10-30--02

TET2基因是位于染色体4q24上,属于哺乳动物TET氧化酶蛋白家族。TET2蛋白作为氧化酶,能够通过改变基因甲基化状态进而起到调控表达的作用。目前在针对髓系肿瘤的研究中发现,多数肿瘤都发现TET2基因突变的情况[1]。为了观察沧州市汉族人群髓系肿瘤遗传的易感性与TET2基因单核苷酸多态性的相关性,我院对近一年来诊的髓系肿瘤患者进行了研究,现报道如下。

1 资料与方法

1.1 患者选择

选择2019年1月-2019年12月至我院进行髓系肿瘤治疗的患者34例作为观察组,所有患者均在沧州居住5年以上,民族为汉族。其中男性患者19例,女性患者15例,年龄16-64岁,平均年龄(47.31±8.22)岁。其中骨髓增殖性肿瘤(MPN)11例,骨髓增生异常综合征13例,急性白血病(AML)7例。随机选择同一时期至我院体检的在沧州居住5年以上的汉族健康志愿者100例作为对照组。其中男性67例,女性33例,年龄18-70岁,平均年龄(51.18±10.73)岁。两组参与研究人员性别、年龄等基线资料无统计学差异(p>0.05),所有参与研究人员均对本次研究知情同意。

1.2 方法

1.2.1 研究方法

所有患者均基于TET2基因单核苷酸检查。

试剂:少量全血基因组DNA提取试剂盒,购自美国OMEGA公司;dNTPs,购自美国Promega公司;引物合成,购自中国通用公司;10×Taq缓冲液、TaqDNA聚合酶,购自美国Thermo公司;DL-1000Marker购自日本TaKaRa公司。

检测步骤:(1)提取DNA。根据OMEGA试剂盒受命去,提取骨髓或者外周血标本中的DNA。取300μml标本于EP管,留取白细胞沉淀,加入试剂盒配备试剂的WTL240μl,水浴,依次加无水乙醇250μl,离心、加HBBuffer500μl,离心,加WashBuffer650μl,离心,洗脱DNA溶液,-80℃储存备用。(2)引物设计。通过数据库检索TET2序列,设计引物,并进行合成。(3)PCR反应。将包含TET2rs2454206、TET2rs12498609的DNA片段进行PCR反应,并将PCR产物电泳、测序、基因分型。R显带技术染色体核型分析。

1.2.2 分析指标

比较两组参与研究人员TET2位点基因型分布情况,以及等位基因频率情况。

1.3 数据处理

用SPSS19.0统计学数据处理软件处理研究中所有相关数据,计数资料采用(n,%)表示,采用χ2检验,以p<0.05为差异有统计学意义。

2 结果

两组参与研究人员的TET2rs2454206、TET2rs12498609基因型分布和位点等位基因频率均有明显差异,观察组TET2rs2454206、TET2rs12498609基因型AA基因型比例高于对照组,且无GG分型。详见表1、表2。

3 讨论

TET2基因是TET氧化酶蛋白家族中的一员,在其羧基末端含有富含半胱氨酸的结构域以及双链β链螺旋结构。前者可以将DNA固定在DSBII的核心结构上。TET2已经证实是维持胚胎肝细胞多能性的转录因子的下游靶点,在多种组织中表达广泛,其中在造血细胞中的表达最高。2008年的一项研究表明,TET2确实的髓系肿瘤患者,其造血干细胞CD34+细胞的增殖能力明显强于TET2未缺失的患者[2]。后續的研究发现,几乎在所有的髓系中环患者中均会发现TET2突变的患者,因此TET2突变已经成为恶性髓系肿瘤的致病标记基因[3]。

在本次研究中,两组参与研究人员的TET2rs2454206、TET2rs12498609基因型分布和位点等位基因频率均有明显差异,观察组TET2rs2454206、TET2rs12498609基因型AA基因型比例高于对照组,且无GG分型。TET2rs2454206观察组等位基因A所占比例明显高于对照组,TET2rs12498609等位基因C所占比例明显高于对照组。因此沧州市汉族人群髓系肿瘤遗传易感性与TET2基因单核苷酸多态性具有一定的相关性,但是仍然需要更大的样本量进行进一步的研究。

参考文献

张艳,吴晓梁,侯金超,等.TET2基因单核苷酸多态性与脓毒症易感性和预后的相关性研究[J].中华急诊医学杂志,2019,28(10):1261-1265.

杨少迪.microRNA靶基因多态性与肿瘤遗传易感性的相关性研究[D].湖南工业大学,2014.

李荣,许明江,杨逢春,等.TET2基因突变在髓系肿瘤中的研究进展[J].中国医学科学院学报,2016,38(5):583-588.

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