林星桦，叶明慧，SEATAN Wanida，潘炎杨，陈芳圆，黄 洋，朱春华，李广丽，田昌绪

多鳞鱚基因家族序列特征及其在低氧胁迫后表达变化

林星桦，叶明慧，SEATAN Wanida，潘炎杨，陈芳圆，黄 洋，朱春华，李广丽，田昌绪

（广东海洋大学水产学院 // 广东省名特优鱼类生殖调控与繁育工程技术研究中心 // 南方海洋科学与工程广东省实验室（湛江），广东 湛江 524088）

【】分析多鳞鱚 () 脯氨酸羟化酶（prolyl hydroxylases, Phds）基因家族序列特征，探讨其在低氧响应过程的作用。通过硬骨鱼类基因，在多鳞鱚转录组和基因组数据中比对筛选多鳞鱚基因。对多鳞鱚Phds蛋白序列进行结构域预测、系统进化和共线性分析等。采用实时荧光定量PCR检测基因在低氧胁迫和复氧后的表达变化。在多鳞鱚基因组中共鉴定到三个基因，分别是、和，开放阅读框 (ORF) 全长分别为1 635、1 092、723 bp，分别编码544、363、240个氨基酸。结构域预测表明，多鳞鱚Phd1、Phd2、Phd3蛋白均含有P4Hc保守结构域。系统进化分析发现，多鳞鱚Phds均与大黄鱼() 亲缘关系最近。共线性分析表明，多鳞鱚与尼罗罗非鱼（）上下游基因高度一致。在低氧处理4 h鳃组织中mRNA表达显著高于常氧组（< 0.05），但在心脏中无显著性差异（> 0.05）；在低氧处理4 h的鳃组织中显著低于常氧组（< 0.05），而在心脏中显著高于常氧组（< 0.05）。多鳞鱚存在、和基因，并在不同组织的低氧响应中起重要作用。

多鳞鱚；基因；基因家族；低氧胁迫；基因表达

缺氧影响大多数有氧动物的代谢和存活（如影响鱼类生长、繁殖以及行为活动），已成为阻碍水产养殖业发展的限制性因子之一[1-2]。低氧诱导因子 (hypoxia inducible factor, HIF) 介导的低氧信号通路是细胞产生低氧应答的核心信号通路之一[3-5]。在常氧时，脯氨酸羟化酶 (prolyl hydroxylases, Phds) 会利用氧分子将HIF-1α蛋白上脯氨酸羟基化，从而被泛素连接酶复合体识别并被蛋白酶降解。……