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不明原因发热患者肺泡灌洗液病毒群落解析

2020-09-21李欣霖刘齐陈旭肖宇晴杨世兴张文陈建国

江苏大学学报(医学版) 2020年5期

李欣霖,刘齐,陈旭,肖宇晴,杨世兴,张文,陈建国

(1. 江苏大学医学院, 江苏 镇江 212013; 2. 江苏大学附属人民医院检验科,江苏 镇江 212002)

不明原因发热是指持续发热3周以上,多次测得体温超过38℃,入院检查1周仍然没有明确原因的发热[1]。不明原因发热病因复杂多样,缺乏特异性的临床表现,同时容易受到治疗药物的影响,通过常规的检测手段很难确诊。能够导致不明原因发热的病因多达200多种,主要包括感染性疾病、结缔组织病、肿瘤性疾病等,其中以感染性疾病为主,而肺部感染又占有较大比例[2]。病毒作为肺部感染的重要病原体之一,是引起发热的重要原因[3]。目前对于病毒的检测,传统的分离培养、免疫学方法以及分子生物学方法发挥了重要的作用,但病毒分离培养效率较慢,分子生物学方法例如PCR技术只能检测出已知序列的病毒,对于新型病毒的检测具有较大局限性,而病毒宏基因组学利用高通量测序技术可以对样本中几乎所有核酸序列进行测定,不仅可以分析样品中病毒群落组成,还能够监测某些致病性病毒的变化情况,并能提前发现潜在的新型致病性病原体。本研究采用病毒宏基因组学技术对不明原因发热患者肺泡灌洗液中的病毒群落进行初步解析,探讨肺部病毒群落与不明原因发热之间的联系。

1 材料与方法

1.1 肺泡灌洗液样本的采集

收集2018年6月至2019年4月在江苏大学附属人民医院诊治的不明原因发热患者(平均年龄67岁)肺泡灌洗液样本共80份,其中58份样本用于文库构建,文库构建后继续收集22份肺泡灌洗液用于阳性样本筛选,并采集40份健康者咽拭子作为阴性对照。……

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