聂 唱,侯佳林,王寅炤,蹇华哗*

(1.上海交通大学生命科学技术学院，上海 200240； 2.上海交通大学微生物代谢国家重点实验室，上海 200240)

希瓦氏菌属(Shewanella)属于γ-变形菌纲，广泛分布于全球海洋和淡水环境中，并且是深海中丰度最高的变形菌类群之一[1]。Shewanella菌具有多样的呼吸能力，厌氧呼吸电子受体包含十几种甚至几十种底物。它不仅能够利用铁、锰等常见金属，还能够将很多不常见的金属或者非金属物质作为电子受体，如碲、硒、碘、钒、钚、铬等等，甚至还有一些菌株能够还原芳香化合物[2]，这些特性使得Shewanella菌在环境生物修复和微生物燃料电池方面有着巨大的应用潜力[3]。同时，Shewanella菌还具有较强的环境适应能力，可以在不同盐度、温度、静水压力的环境条件下生存[4]。对于Shewanella菌基因组的研究将有助于了解其适应机制，进一步阐释该属细菌在自然环境中的生态意义。

深海嗜冷希瓦氏菌ShewanellapsychrophilaWP2(以下简称为WP2)和ShewanellapiezotoleransWP3(以下简称为WP3)分离自西太平洋水深1 914 m深海沉积物。WP2是革兰氏阴性兼性厌氧菌，最适生长温度为10～15 ℃，最适生长压力为20 MPa，具有嗜冷嗜压特性[5]。WP2可以利用葡萄糖、蔗糖、N-乙酰氨基葡萄糖和多种氨基酸等种类丰富的碳源，厌氧呼吸可以利用硝酸盐、氧化三甲胺(TMAO)和二甲基亚砜(DMSO)作为电子受体[6]。虽然WP2和WP3已经完成全基因组测序[6]，但是WP2的进化地位、基因组特征和代谢潜能仍未有深入研究。WP3为兼性厌氧细菌，最适生长温度为15～20 ℃，最适压强为20 MPa。与WP2相似，WP3也可以利用多种碳源，厌氧呼吸时可以利用硝酸盐、延胡索酸、TMAO、DMSO和三价铁作为电子受体[5,7]。……