非洲猪瘟病毒微滴式数字PCR检测方法的建立与应用
2020-09-11张继红唐小兰张海韵郭焜鹏
严 礼,宋 晟,张继红,唐小兰,张海韵,郭焜鹏
(食品安全监测与预警湖南省重点实验室,湖南省食品质量监督检验研究院,长沙410117)
非洲猪瘟(African swine fever,ASF)是由非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)引起的一种猪的急性、出血性传染病,因其严重危害养猪业,且无有效的疫苗防治,世界动物卫生组织(Office Inter-national des Epizooties,OIE)将其列为法定上报传染病。我国将其列为一类传染病,在国务院办公厅印发的《国家中长期动物疫病防治规划(2012-2020年)》中,非洲猪瘟是作为13种重点防范的外来动物疫病之一[1-4]。非洲猪瘟于2007年4月在格鲁吉亚爆发,同年11月,俄罗斯发生首例非洲猪瘟,并逐渐蔓延至俄罗斯远东地区。2018年非洲猪瘟在我国蔓延,严重威胁我国养猪业的发展,个别省份发生大规模的生猪减产,并存在非洲猪瘟病死猪肉流入市场的风险。因此,建立一种特异性强、灵敏度高、重复性好的病毒检验方法迫在眉睫[5-9]。
微滴数字 PCR(droplet digital PCR,ddPCR)是近几年出现的新一代聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)技术。利用油包水技术将反应液分割为数万个纳米级大小的微滴,每一个微滴都是一个独立的PCR反应体系,当PCR扩增完成后,利用微滴分析仪逐个对每个微滴进行检测,再根据统计学中的泊松分布原理分析阳性微滴的个数与比例,即可得出靶分子的起始拷贝数或浓度,从而实现对低至单个拷贝核酸分子的绝对定量。与传统实时荧光定量 PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)方法相比,它不依赖于标准曲线,因而定量结果更为精确,同时也使体系受反应抑制因子的影响大大降低[10-17]。
本研究根……
