安康市花魔芋matK基因的克隆及分析
2020-08-11周晓帆李静王瑞
周晓帆 李静 王瑞


摘要:以安康市花魔芋(Amorphophallus konjac)为材料提取基因组,对matK基因序列进行扩增,扩增产物经凝胶电泳分析后送生物技术公司测序,并对测序结果进行分析。结果表明,安康市花魔芋matK基因全长1 551 bp,预测编码516个氨基酸;系统进化树结果显示,花魔芋与Amorphophallus maxwellii、田阳魔芋(Amorphophallus corrugatus)和西盟魔芋(Amorphophallus krausei)的亲缘关系最近。
关键词:花魔芋(Amorphophallus konjac);matK基因;序列分析;安康市
Abstract: The genome of the Amorphophallus konjac from Ankang city was extracted and the matK gene sequence was amplified. After confirmed by gel electrophoresis, amplified product was sequenced and analyzed. Results showed that the matK gene of Amorphophallus konjac from Ankang city was 1 551 bp in length and predicted to encode 516 amino acids. The phylogenetic tree showed that the Amorphophallus konjac had the closest relationship with Amorphophallus maxwellii, Amorphophallus corrugatus and Amorphophallus krausei.
Key words: Amorphophallus konjac; matK gene; sequence analysis; Ankang city
魔芋(Amorphophallus rivieri Durieu)为多年生天南星科草本植物,是世界上惟一能够大量提供葡甘露聚糖的重要经济作物。目前已命名的魔芋种属达200多个,中国已记载的魔芋属种约20种[1],广泛分布在秦岭大巴山、四川盆地、云贵高原、滇南和台湾等地区[2]。当前的魔芋种植是在传统的栽培基础上发展起来的,地方品种之间的特性差异较大[3],种质资源性状差异明显,遗传多样性丰富[4],为魔芋的分类及种质资源鉴定带来了一定困难。
近年来,分子标记技术已成为检测植物种质资源多样性和鉴定种质亲缘关系的重要工具,显示出较好的应用前景[5]。matK序列位于叶绿体基因组trnK基因的内含子中,是叶绿体基因组蛋白编码基因中进化速率最快的基因之一,被广泛应用于植物种质资源的鉴定和亲缘关系的研究[6-8]。位于秦巴腹地的陕西省安康市有着悠久的魔芋种植历史[9]。本研究从安康市花魔芋(Amorphophallus konjac)中克隆得到matK基因的全长序列,并对其进行简单的生物信息学分析,为魔芋的种质资源鉴定和亲缘关系研究提供借鉴。
1 材料与方法
1.1 试验材料
试验所用花魔芋由安康学院保存,取新鲜叶片用去离子水冲洗干净,吸水纸吸干后于-80 ℃保存备用。……
