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基于生物信息学分析哮喘患者鼻黏膜上皮细胞DNA及α肌动蛋白2甲基化差异性表达

2020-07-21张黎莎钱粉红

江苏大学学报(医学版) 2020年4期
关键词:水平分析研究

张黎莎, 钱粉红

(江苏大学附属医院呼吸内科, 江苏 镇江 212001)

哮喘发病同时受环境及遗传因素影响[1]。DNA甲基化是表观遗传学的重要组成部分,也是哮喘发病中重要的生物学标志物[2]。研究发现,胎儿出生时全基因组DNA甲基化水平与儿童期哮喘风险相关,以及包括香烟烟雾或交通尾气暴露等多种变应原刺激可改变基因甲基化水平诱发哮喘[3-5]。然而,目前我国哮喘患者全基因组甲基化水平是否与健康者存在差异尚不清楚。

α肌动蛋白2(actin alpha 2,ACTA2)位于10号染色体,主要功能为编码肌动蛋白,在所有细胞中均有广泛表达。研究表明,ACTA2可通过影响细胞骨架功能促进肺腺癌侵袭和转移[6]。ACTA2基因突变或缺失可引起平滑肌收缩力减弱,此外,ACTA2表达降低可激活NF-κB,致IL-6表达升高[7-9]。但ACTA2甲基化水平与哮喘发病关系尚不清楚。因此,本研究首先对哮喘患者鼻黏膜上皮细胞全基因组DNA甲基化水平进行检测分析,其次对ACTA2基因在哮喘患者中的差异性甲基化表达进行研究,综合分析哮喘患者甲基化改变情况。

1 对象与方法

1.1 研究对象

1.1.1 全基因组甲基化测序(850K芯片)研究对象 选择2017年10月至2018年10月于江苏大学附属医院呼吸科门诊就诊的成人哮喘患者6例为哮喘组,另选择同期、同居住地、年龄相近、性别比例相似,且与哮喘组患者无直接血缘关系的健康体检者5例为对照组,一般资料如表1所示。本研究通过江苏大学附属医院伦理委员会批准,且受试者均已签署临床研究知情同意书。

1.1.2 ACTA2启动子检……

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