DNA存储中的编码技术
2020-07-08顾万君陆祖宏
生物信息学 2020年2期
毕 昆,顾万君,陆祖宏
(生物电子学国家重点实验室(东南大学,生物科学与医学工程学院),南京 210096)
全球数据信息总量将由2018年的30 ZB增长至2025年的163 ZB, 该趋势将很快超过现有硬盘等存储介质的承受能力。脱氧核糖核酸(Deoxyribonucleic Acid, DNA)数据存储技术开辟了一种新的存储模式, 其发展对于节省存储能源及推进大数据存储发展有着重要作用。利用DNA分子进行信息存取的想法早在60年代就已出现,由于DNA信息的读写较为困难,直到1988年才开始出现利用DNA保存少量信息的实验性工作,信息量极小,缺乏实际应用。随着二代测序技术的发展,出现了真正具有突破性进展的DNA存储工作。2012年,哈佛医学院的Church团队通过在DNA中存储650 KB的数据,第一次以体外存储方式实现了较大数据的DNA存储,实现了DNA存储的实际应用[1]。之后DNA数据存储逐渐成为全球研究的热点,包括哈佛大学、哥伦比亚大学、微软研究院、华盛顿大学和剑桥大学等国内外多家研究机构均展开对DNA存储的研究,并取得一定的进展,但仍有许多难题需要攻克。
DNA是一种天然的信息存储介质,DNA具有存储密度高、存储时间长、损耗率低等特点,在传统存储方式不能满足信息增长的需求时,DNA数据存储技术逐渐成为生物信息领域的研究热点。DNA存储是将数据通过DNA编码算法转换为DNA分子链中不同碱基的序列信息并存储于相应的存储载体,需要时通过特定的DNA解码算法进行读取操作,重新生成原始数据。DNA存储最明显的优势是存储量巨大,1 kg的DNA可以存储全世界所有的信息,同时具有安全性高、存储时间长、保存稳定等优点。……
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