土司

罗米·阿玛罗在上个月几乎没有睡觉，她的声音嗡嗡作响，这位加州大学圣地亚哥分校的生物物理学家在过去的几周中，带领她的国际研究团队一直在努力工作，以提供一种强大的新工具来对抗全球病毒大流行。他们正在创建一个移动的新冠肺炎病毒数字复制品（使用超级计算机进行模拟），以力求精确到微生物的单个原子。

通过详细可视化冠状病毒的行为，阿玛罗希望确定其结构的漏洞，然后研究人员可以利用这些漏洞来开发预防感染的药物或疫苗。“一旦知道病毒的工作原理，就可以从战略上使其停止运行。” 阿玛罗说：“要使高速的汽车停下，就要给轮胎放气！”

借用超级计算机模拟病毒程序

阿玛罗小组通过远程登录位于奥斯汀的德克萨斯高级计算机中心的超级计算机Frontera，建立了逐个原子的仿真程序。他们正在努力模拟病毒的整个外部结构，该结构包括脂肪膜和位于其表面的蛋白质。

随着其他研究人员发布新数据，团队不断完善他们的模拟。4月初，在英国研究人员发布有关冠状病毒表面装饰的糖分子的新细节之前，他们拥有了“一种基本可以运行的模型”，然后团队急于整合新数据，“这无疑是迄今为止我一生中最激动人心的科学时刻。” 阿玛罗说。

阿玛罗小组完成的模拟将描绘2亿个原子的运动，这是一个很小的数据，比如一粒盐就含有1000亿倍的原子。另一方面要模拟的运动部件很多，他们的目标是跟踪病毒表面上任何不稳定的球体中每个单独原子的运动。……