虎杖PcMYB1基因实时荧光定量PCR检测方法的建立
2020-06-13林艳丽李鲁汉廖辉覃建兵伍翔王岩岩吴端阳张鸿杰柳忠玉长江大学生命科学学院湖北荆州434025
林艳丽, 李鲁汉, 廖辉, 覃建兵, 伍翔 王岩岩, 吴端阳, 张鸿杰, 柳忠玉 (长江大学生命科学学院, 湖北 荆州 434025)
虎杖(PolygonumcuspidatumSieb.etZucc.)是蓼科多年生药用草本植物,药用历史悠久。本课题组通过RT-PCR和RACE技术从虎杖中获得了1个新的MYB转录因子,命名为PcMYB1。MYB转录因子是最大的植物转录因子家族成员之一[1, 2],该转录因子广泛存在于植物中,拟南芥中至少包含208个MYB转录因子。根据保守序列结构和功能的不同,MYB转录因子可以划分为28个亚家族[3]。该类基因具有重要的生物学功能,可调控植物生长发育和器官的模式建成,参与多种植物逆境防御反应和植物次生代谢调控[4, 5]。若要对PcMYB1基因在虎杖中mRNA水平的表达进行定量检测,从而进一步研究该基因的功能,就需要一种能准确定量的检测方法。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测方法简便准确,已经广泛用于多种基因的检测与表达分析[6, 7]。该研究根据虎杖PcMYB1基因序列设计特异引物,PCR扩增PcMYB1基因,亚克隆于pUC19载体中后,测序鉴定并制备重组质粒,试图建立一套标准的qRT-PCR方法,为进一步研究PcMYB1基因在虎杖中的功能奠定基础。
1 材料与方法
1.1 材料
野生型虎杖植株种植于长江大学苗圃;大肠杆菌菌株DH5α、pUC19载体质粒由笔者所在实验室保存;cDNA第一链合成试剂盒和胶回收试剂盒购自Tiangen公司;荧光定量试剂盒购自Monad公司;限制性内切酶、Taq DNA聚合酶、T4连接酶购自TaRaKa公司。
1.2 方法
1.2.1 总RNA提取和cDNA的合成
取虎杖叶片使用Trizol试剂裂解细胞并按照说明书提取细胞总RNA。利用核酸浓度测定仪测定总RNA浓度、检测RNA溶液在260nm和280nm波长下的光密度并读取两者比值(D260/280),通过琼脂糖凝胶电泳确定提取的总RNA的完整性。……
