神经血管单元多靶点抗缺血性脑卒中的相关靶标及通路研究
2020-06-01黄清梁萍2欧阳扬2刘蕾2杨鎏鑫2刘佩2刘玥彤2蒙兰青
右江民族医学院学报 2020年2期
关键词:差异
黄清,梁萍2,欧阳扬2,刘蕾2,杨鎏鑫2,刘佩2,刘玥彤2,蒙兰青
(1.右江民族医学院附属医院,广西 百色 533000;2.右江民族医学院研究生学院,广西 百色 533000)
缺血性脑卒中是受到遗传和环境因素影响的系统性疾病,发生的分子机制是多基因、多功能蛋白相互作用的调控网络异常所致。氧/糖剥夺(OGD)细胞模型能够模拟脑卒中的病理状态,常用于模拟缺血性脑卒中的体外实验[1]。神经血管单元(NVU)将脑卒中的组织关联反应视为一个整体,体现为神经元、神经胶质细胞和微血管之间相联系及相互影响[2]。基因表达量的改变是缺血性脑卒中的重要特征,它的改变也伴随着对多种蛋白质功能的影响[3]。筛选缺血性脑卒中神经血管单元的差异表达基因,对探索缺血性卒中早期诊断的生物学标志物、发病机制和发现药物靶标等都有重要的意义。本研究基于神经血管单元的主要组成成分,整合缺血性脑卒中体外模型的神经元、星形胶质细胞和血管(血管内皮细胞、周细胞)芯片数据集的差异表达基因,并对各组成成分构建PPI互作网络、功能注释及通路分析等,为多靶点治疗缺血性脑卒中提供新的理论基础。
1 材料与方法
1.1 神经血管单元GEO芯片来源 GEO数据库[4]中的GSE54037、GSE3045、GSE76739和GSE109233的芯片数据(见表1)。GSE54037[5]由葡萄牙神经科学与细胞生物学中心提供,该研究利用全基因组测序鉴定大鼠海马神经元在缺氧缺糖(OGD)中的表达差异基因,实验分有对照组和OGD组(n=6),每组分别在7 h和24 h(n=3)检测大鼠海马神经元的基因表达。……
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