蛙皮素样肽家族及其受体氨基酸序列信息学比较分析
2020-05-21赵树林李璐璐孙小燕阿迪莱艾力赵红琼
赵树林,李璐璐,孙小燕,阿迪莱·艾力,赵红琼
(新疆农业大学动物医学学院,乌鲁木齐 830052)
0 引 言
【研究意义】蛙皮素(Bombesin)最早分离于Bombina蛙皮肤,是一种由14个氨基酸组成的多肽,具有促进胃液分泌的作用[1,2]。将与蛙皮素C-端氨基酸具有同源性的多肽称为蛙皮样肽(Bombesin-like peptide, BLP),BLP家族根据其C-端氨基酸的同源性分为蛙皮素、牛蛙肽(Ranatensin)和叶泡雨滨蛙肽(Phyllolitorin)3个亚家族[3],其氨基酸序列比对见图1,且所有多肽C-端甲硫氨酸被氨基化(-NH2)。【前人研究进展】蛙皮素亚家族包括蛙皮素、产婆肽(Alytesin)和胃泌素释放肽(Gastrin-releasing peptide, GRP)。GRP分离于哺乳动物,为27或29个氨基酸序列,具有促进胃泌素分泌的作用,且在哺乳动物还发现了同GRP的C-端10个氨基酸序列完全相同的神经介素C(Neuromedin C, NMC)。牛蛙肽亚家族包括牛蛙肽和分离于哺乳动物的神经介素B(Neuromedin B, NMB)等[4]。NMB具有促进大鼠平滑肌收缩等作用[5]。【本研究切入点】目前,在哺乳动物发现的BLP家族多肽仅有GRP和NMB,用分别通过GRP受体(GRP-R)和NMB受体(NMB-R)起作用[6],并且2种受体均为7次跨膜(7-Transmembrane, 7-TM)受体[7]。由于动物不同,BLP家族多肽或受体氨基酸序列不同,在进行不同动物BLP家族多肽功能研究或其相应抗体制备过程中,需要关注目的动物BLP氨基酸序列的特异性及其同源性,并进行氨基酸信息学分析比较。针对BLP家族氨基酸信息学分析的文献仅见Graham团队对21种动物进行了比较[8],但其主要对BLP家族全肽(例如:PreproGRP)进行分析,而未关注最终起作用的成熟肽,特别是反刍动物BLP序列与其他动物的不同。【拟解决的关键问题】研究比较GRP和NMB 2种多肽激素及其受体的氨基酸序列在不同动物物种间的差异性,特别是牛等反刍动物同其他动物之间的序列差异,并进行生物信息学分析,为在反刍动物进行BLP家族多肽结构和功能研究提供参考。……
