李晓凯 范一星 乔贤 张磊 王凤红 王志英 王瑞军，2，3 张燕军，2，3 刘志红，2，3 王志新 何利兵 李金泉，2，3 苏蕊，2，3 张家新

（1. 内蒙古农业大学动物科学学院，呼和浩特 010018；2. 农业部肉羊遗传育种重点实验室，呼和浩特 010018；3. 内蒙古自治区山羊遗传育种工程技术研究中心，呼和浩特 010018；4. 内蒙古金莱牧业科技有限责任公司，呼和浩特 010018）

基于考古学和遗传学等方法的研究表明，家山羊是约在10 000 年前的新石器时代由西亚肥沃新月地带的野山羊（Bezoars，Capra aegagrus）驯化而来，是最早驯化的反刍动物之一［1-2］。随着人类的迁徙与演化，山羊是目前全球范围内分布最广泛的牲畜物种之一，主要用于生产肉、奶、皮和毛（绒）等农业生产资源［3-4］。据统计资料显示，全世界范围内共有10 亿多只不同生产用途的山羊饲养在各种生态区内，超过90%的山羊分布在亚洲和非洲；其次是美洲、欧洲和大洋洲，包括肉用、乳用、皮毛用、绒毛用和普通山羊等不同生产用途的576 个山羊品种（http：//www.fao.org/faostat/en/）［4-5］。山羊是发展中国家农牧民重要的家畜之一，但相对于奶牛、家猪、绵羊和家马等经济效益较高的牲畜品种，山羊的分子生物学研究和遗传育种工作总体相对落后，严重阻碍了发展中国家贫困偏远地区的经济发展［6］。

随着人类基因组计划的实施与完成，单核苷多态性（Single-nucleotide polymorphism，SNP）因具有数量多，分布广泛，易于快速、规模化筛查，便于基因分型等特点，已成为动物种质资源遗传多样性评估和基因功能定位研究的有力工具［7-9］。高通量测序技术的应用极大地促进了家畜基因组组装和遗传变异检测的研究［10-11］，如家牛［12］、家马［13］、家猪［14］、山羊［15］和绵羊［16］等参考基因组组装以及第一款家牛商业化芯片的研制［17］。……