马佳康，任凯凯，李雨濛，李 南，张 玲，王 健，孙金旗，周 博，马 军

0 引 言

原发性肝细胞癌是常见的恶性肿瘤［1］，据欧美国家统计显示，从2010年开始，男性肝细胞癌发病率处于平台期，而女性肝细胞癌发病率却在迅速增加；通过加强肝炎病毒筛检和研发新的抗病毒药物，可明显降低肝细胞癌的风险［2］。因此，我们需要进一步探索其发病机制，找到更有效的诊断标记和治疗靶点。

数据显示人类基因组中90%以上的序列可以被转录，但只有1%～2%的序列可以编码蛋白质。根据其转录本的长度可以分为＜200 个核苷酸的小RNA，和＞200 个核苷酸的长RNA（lncRNAs）。近年来发现lncRNAs可能在肿瘤发生发展中发挥重要作用，但对于其生物学功能目前仅有少部分被证实。lncRNAs 具有多种功能，如诱饵、支架，指导信号分子参与许多重要的生物过程，如染色体沉默、基因组印记、染色质修饰、转录调节和miRNAs 功能调节［3-4］。其中，lncRNAs 通过竞争性內源RNA（ceRNA）机制调控基因表达也已经被证实［5-6］。肝细胞癌相关lncRNAs 的研究，将为其预防和控制提供新的思路和方法［7］。目前，已发现数十种和肝细胞癌相关的lncRNAs，如H19、HULC、MALAT-1、HOTAIR和HOTTIP 等［5，8-13］。本研究旨在分析TCGA 数据库中白色人种、黑色人种和黄色人种肝细胞癌共有和特有lncRNAs差异谱并预测其功能和调控机制。

1 资料与方法

1.1 数据下载和差异基因筛选从TCGA 数据库共下载349例肝细胞癌患者的临床资料和转录组数据。另外下载相应病例的miRNAs 测序数据。通过R 语言edgeR 包对mRNAs、lncRNAs 及miRNAs 的基因样本分别进行差异分析，标准为｜log2FC｜＞2 且FDR＜0.05［14］。

1.2 lncRNAs 筛选和功能分析通过对白色人种、黑色人种和黄色人种肝细胞癌患者的癌和癌旁组织进行差异分析得到各自的差异的lncRNAs，并比较3 个人种差异lncRNAs 基因谱情况，采用韦恩图找出3个人种共有的差异lncRNAs。……