齐骜穹，曾 莎，王燕新，廖圆圆，蔡 勇，杨具田

(西北民族大学 生命科学与工程学院，甘肃 兰州 730030)

细胞是一种通过大量不同性质的相互协调机制完成自我复制和适应外界环境改变等过程的个体，是生物体结构与功能的基本单位[1]，理解细胞功能和细胞间信息交流是现代生物学的基本目标.DNA包含必要的遗传信息，形成一个具有结构性或功能性的有机大分子.中心法则描述了一个信息流，从DNA到RNA再到蛋白质.然而近年来的研究成果使得这一法则遭遇到了挑战[2].表观遗传、剪接、非编码RNAs(包括microRNAs，miRNAs和lncRNA)、蛋白质与蛋白质相互作用(protein-protein interaction，PPI)和翻译后修饰(Post-translational modification，PTM)等都说明了基因型对表型的影响并不是惟一的.蛋白质作为细胞内关键的功能实体，表达了细胞功能的主要信息，故对蛋白质进行全面的分析也是理解细胞功能和细胞间交流的重要途径，这种研究方法被称为蛋白质组学[3].

1 蛋白质组学

蛋白质组是指一个基因组或一类细胞表达的蛋白质总和[4].目前暂时定义为特定时空存在于细胞、组织、器官和有机体内的全套蛋白质[5].随着蛋白质组的提出，产生了蛋白质组学，以蛋白质作为研究对象，检测细胞、组织或有机体内全部蛋白质的组成、蛋白质的表达水平以及蛋白质修饰，以了解PPI以及蛋白质动态变化规律的学科[6].

蛋白质组学作为后基因组时代的重要探究方法之一，受到了研究学者的关注.然而，蛋白质组水平上收集数据的难度远远大于基因组水平……