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基于CAPS标记的西瓜遗传连锁图谱 构建及3个性状定位分析

2019-09-19张志鹏张亚楠孙蕾邱果孙宇姣朱子成栾非时王学征

中国瓜菜 2019年8期

张志鹏 张亚楠 孙蕾 邱果 孙宇姣 朱子成 栾非时 王学征

目的与意义:西瓜的果肉颜色、果皮条纹、果肉苦味是西瓜重要农艺性状,可直接影响消费者的选择。目前关于西瓜性状的QTL有很多,但对这3个性状的定位研究还不是很清晰。尤其是苦味性状,葫芦科(西瓜、甜瓜、苦瓜等)中苦味基因的分子标记和精细图谱的研究较少,相关研究报道较少或没有。因此笔者通过配制杂交组合,通过生物信息设计分析,建立了225株BC1分离株的遗传连锁图谱。通过对西瓜果肉颜色、果皮条纹、果肉苦味相关位点的数据挖掘,获得紧密连接的标记,希望为分子标记辅助育种提供理论依据。

材料与方法:以绿皮窄条纹、红色果肉、无苦味的西瓜自交系‘W1-1(P1)和绿皮宽条纹、白色果肉、具极端苦味的西瓜自交系‘PI 186490(P2)为亲本配制F1,F1自交配制 F2分离群体,F1与P1回交配制回交群体BC1P1。对BC1P1群体225株单株编号,分别采集嫩叶提取DNA,基于亲本的重测序数据和已发布的西瓜参考基因组数据,构建了1张包含186个CAPS标记、11个连锁群的遗传连锁图谱,该图谱覆盖基因组长度1 468.09 cM。

结果与分析:‘W1-1 (红色果肉)和‘PI186490(白色果肉)的F1代是黄色果肉(原图1)。在BC1P1群体中分离出四类肉色(红、黄、橙和黄/白混合)。在BC1和F2群体中,不仅亲本的颜色分离,而且出现了亲本中不存在的橙色和黄色,以及所有可能的红、橙、黄和白色的二元混合物。仅以红肉为标准,将种群的肉分为红肉和非红肉两大类,合理简化了肉色性状的复杂表达。表达显性性状(非红色)的个体数为111,表达隐性性状(红色)的个体数为114。……

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