任毅 张岩 宫国义 张海英 郭绍贵 孙宏贺 蔡万涛 张洁 许勇

目的与意义：人们长期对于现代栽培西瓜优良性状的选育使得西瓜遗传基础变得狭隘。野生亚种是西瓜育种中优异基因的重要来源，但将野生亚种中的优良性状基因转入到现代栽培西瓜中的成功率很低。由于缺乏高质量的遗传图谱致使分子标记辅助选择（MAS）在西瓜中的应用尚未实现，难以在图谱之间进行整合和比较分析。本研究的目的是整合现有的利用单核苷酸多态性（SNP）和简单重复序列（SSR）标记构建西瓜整合遗传图谱。

材料与方法：使用4种不同杂交组合的西瓜群体作为试验材料，其分别为栽培品种‘97103和野生种‘PI 296341-FR杂交产生的103株系重组自交系（RIL）F8群体，以及由北美栽培种‘ZWRM50和野生种‘244019（ZWRM × citron） 杂交产生182单株F2群体，164株系 [栽培种Klondike Black Seeded ×栽培种New Hampshire Midget（KBS × NHM）] RIL群体，还有187单株[栽培种Strain II ×半野生种PI 560023 （SII×egusi）] 的F2群体。通过将SNP标记添加到bin来构建整合图谱。使用不同的计算机软件来比较共线性数据、测量糖含量、计算遗传力（h2）置信区间（CI）、分析性状间的遗传相关性、联合分析单一环境和多环境互作效应。

结果与分析：作者整合了SSR（简单重复序列）标记698个，InDel（插入缺失标记）标记219个， SV（结构变异）标记36个和SNP标记386个来构建整合图谱。该图谱包含1 339个标记，跨越798 cM，平均标记间隔为0.6 cM。西瓜基因组的大小为425 Mbp，此处的图谱每个标记有317 Kb的平均物理区间，使其成为迄今为止最饱和的西瓜数据图谱。最大数量的标记（159）位于第1号染色体上，其最长遗传距离为115.4 cM，而第8号染色体仅有90个标记，跨越29.2 cM，使其成为遗传距离最小的染色体（图1）。……