张海英 王慧 郭绍贵 任毅 宫国义 翁益群 许勇

目的与意义：西瓜作为重要的经济作物，在我国种植业结构调整和促进农民致富增收中发挥着重要作用。当前西瓜生产中种子质量问题比较突出和普遍，种子纯度不够和假种子坑农事件常有发生，严重干扰了种业的健康发展，也是对品种创新与知识产权保护的严重损害。常规的品种鉴定难以依靠品种形态特征进行准确、快速的品种鉴别。SSR技术具有共显性、重复性好等优点，但如果将基因组的所有SSR位点对供试种质一一进行分析，需要耗费大量的人力和物力。针对上述现有技术的问题，本研究将依据西瓜基因组序列开发一套SSR核心標记，可用于西瓜种质资源核酸指纹库构建和遗传背景等研究。

材料与方法：（1）供试材料为北京市农林科学院蔬菜研究中心的17份重测序材料和100份遗传背景清晰的育种材料。（2）SNP数据：利用Illumina GAII测序平台对东亚生态型西瓜自交系‘97103和其他16份材料进行全基因组测序和重测序，获得的相关数据。（3）西瓜SSR核心引物的开发策略：第一，依据覆盖整个基因组的近390万个SNP位点对17份重测序材料绘制SNP系统发育树。第二，以栽培种‘97103（东亚生态类型）和‘Sugarlee（美洲生态类型）为材料，利用西瓜高密度遗传图谱中双亲表现多态的704对SSR引物，获得在2个栽培种之间中具有多态性的78对SSR引物。第三，利用上述78对SSR引物对17份重测序材料进行扩增。在此基础上，不断调整各种引物组合，最终获得23对核心引物组合。……