薛 蓓,侯 磊,薛会英

西藏农牧学院,林芝 860000

土壤线虫是土壤动物中的优势类群,被认为是地球上数量最大的多细胞生物[1-2]。土壤线虫有多种食性,其功能(营养)结构是土壤物质循环和能量流动的重要决定因素之一,同时也能够提供土壤腐屑食物网机能方面的信息,土壤线虫在草地生态系统中往往被看作是主要的消费者,与草地生产力密切相关[3-7]。

传统的形态学分离鉴定土壤线虫需要借助显微镜分辨,而且鉴定人员需要进行专业的培训,耗时耗力[8],例如从单个样品中分离鉴定100—150个土壤线虫需要专业研究人员花费1 h以上[9]。21世纪以来,新一代高通量测序技术的发展日新月异,可直接测序 16S rRNA 基因的 PCR产物,每次分析获得的基因序列数以百万甚至亿万计,不仅通量高,而且能够同时分析上百个不同的样品,是解析复杂环境中微生物群落物种组成和相对丰度的重要工具[10-11]。

目前,高通量技术在线虫研究中得到了一定的应用[12],如国外学者对热带雨林和北极地区的线虫多样性[13]、地中海灌木丛线虫多样性[14]的研究以土壤活线虫作为一种生物指标,研究分析外来植物在沿海沙丘生态系统中的侵袭作用[15]、热带和温带雨林的线虫空间和生态模式[16]和热带雨林生物多样性[17]等。国内如冯陈晨等对骆驼斯氏副柔线虫转录组进行高通量测序及分析[18]。

本文通过Illumina MiSeq测序技术,在 97%的相似水平下对所测得序列进行OUT聚类和生物信息学分析,研究藏北高寒草甸不同土壤深度线虫群落结构特征,目的是全面了解高寒草甸不同深度土壤线虫群落多样性,为进一步研究不同植被不同气候变化下土壤线虫群落特点提供依据。……