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基于生物信息分析学方法筛选多发性骨髓瘤差异表达基因

2019-06-18何思羽王清

山东医药 2019年15期
关键词:差异信号分析

何思羽,王清

(西南医科大学附属医院,四川泸州 646000)

多发性骨髓瘤(MM)是一种起源于浆细胞异常增生的单克隆恶性肿瘤性疾病,常伴有不同程度的骨损害,表现为骨骼破坏、顽固性疼痛、病理性骨折、高钙血症及脊髓受压等,又称之为骨髓瘤骨病(MBD),是第二常见的血液系统恶性肿瘤[1]。近年来,随着蛋白酶体抑制剂(PIS)、免疫调节药物(IMID)的应用及自体干细胞移植(ASCT)的进行极大改善了MM患者的预后,然而当前仍无法完全治愈,预计2018年在美国MM的死亡可能会达到1 2000人[1,2]。研究[3,4]发现,分子细胞遗传学异常与克隆异质性和克隆进化关系密切,在MM发病中发挥着重要作用。高危细胞遗传学异常患者更容易出现克隆异质性和克隆进化现象,与疾病的发展和预后密切相关,故针对MM的临床和生物学上的异质性,从分子水平探索其治病机制,开发精准治疗方案,进一步改善患者预后,提高生命质量具有重要意义。高通量信息技术的发展为疾病基因改变的研究带来了巨大便利,利用生物信息分析学方法有助于探索分子改变与疾病预后的关系,快速挖掘有效的分子靶标,进一步实现肿瘤精准治疗的研究方向[5,6]。本研究采用生物信息分析学方法从GEO数据库下载并整理有关MM基因微阵列数据,获得肿瘤发生发展过程中显著差异表达基因(DEGs),从而筛选出可能参与MM发生发展的基因,旨在为探索MM的发病机制、诊断及治疗提供基础。

1 资料与方法

1.1 资料搜集 利用NCBI中基因芯片公共数据库(GEO)芯片数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.go),以“multiple myeloma,Homo”为关键词搜索目标芯片。……

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