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一种双层基因调控网络的构建方法

2019-05-14张莉彬宋凯利

数字技术与应用 2019年2期

张莉彬 宋凯利

摘要:基因网络是一种复杂的生物网络,描述了基因与其他作用因子之间的调控关系。相同的基因可以和不同的调控因子通过相关作用关系构成基因调控网络,而miRNA是近年来研究发现的一种新型基因调控元件,现已成为基因调控网络的重要组成部分。鉴定与多种癌症相关的miRNA及其靶基因,有助于了解基因与癌症等复杂疾病的关系,并为针对泛癌症的生物药物研制及靶向治療提供参考。

关键词:基因;miRNA;癌症

中图分类号:TP301.6 文献标识码:A 文章编号:1007-9416(2019)02-0057-02

0 引言

MicroRNA简称miRNA,是一类内源性非编码的小RNA分子,它们通过与靶基因相互作用来调控复杂疾病的生物过程,尤其在许多癌症进程中起到了关键作用。针对单一基因或miRNA的研究对深入了解癌症的病发过程具有一定的局限性,本文则通过研究与泛癌症相关的基因和miRNA数据,对miRNA之间和基因之间做关联分析,提出了一种miRNA-基因双层调控网络的构建方法,解释了参与调控多种癌症过程的重要作用因子之间的合作机制,为癌症的风险预测以及生物靶向药物的研制提供帮助。

1 双层基因调控网络的构建方法流程

1.1 构建方法流程图

构建双层基因调控网络的方法包括:分析网络中重要调控因子miRNA的表达数据;利用统计检验方法选出与多种癌症相关的miRNA;度量miRNA之间的皮尔森相关性;根据可调控癌症的数量和相关性对miRNA进行排序,筛选出强相关的miRNA,获取其靶基因以及它们之间的相互作用关系[1]。……

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