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高产纤维素酶真菌的筛选及鉴定

2019-04-10李豪邹伟白光剑徐静

食品与发酵工业 2019年6期
关键词:产酶孢菌纤维素

李豪,邹伟,2*,白光剑,徐静

1(四川理工学院 生物工程学院,四川 自贡,643000) 2(酿酒生物技术及应用四川省重点实验室(四川理工学院),四川 自贡,643000)

农作物秸秆是目前自然界中最丰富的可再生资源,目前的利用方式主要包括还田、秸秆饲料、秸秆能源、秸秆工业原料和栽培食用菌[1]。农作物秸秆的主要成分为纤维素、半纤维素以及木质素[2-3],3种物质相互结合形成木质纤维素占秸秆干重的一半以上[4]。目前化学处理法如稀酸、浓酸处理等会带来成本问题、环境污染而难以推广,物理处理法多高耗能而不宜推广[5-6]。使用微生物处理秸秆具有绿色环保、成本低的优势,近年来受到越来越多的关注。

目前主要运用高产纤维素酶的菌株来处理农作物秸秆。纤维素酶是由多种复合酶系组成,主要包括内切葡聚糖酶、外切葡聚糖酶和β-1,4葡萄糖苷酶,3种酶相互协同作用于纤维素,并将其降解[7-8]。纤维素酶主要来自细菌与丝状真菌,细菌由于产酶不多且多产在胞内故较少作为纤维素酶生产菌[9],霉菌产生的菌丝能进入纤维素、半纤维素和木质素之中,分泌的纤维素酶能由内而外地降解纤维素,降解能力较强[10]。目前已发现有多种微生物菌属有纤维素降解功能,其中包括木霉属(Trichoderma)、曲霉属(Aspergillus)、青霉属(Penicillium)等菌株[11-12]。关于产纤维素酶真菌的筛选目前也有很多,田云等[13]从蘑菇培养基质中获得1株高产纤维素酶的肉座菌株(Hypocrealessp.)真菌,李晓秀等[14]从土壤中筛选获得1株尖孢镰刀菌(Fusariumoxysporum),曾思泉等[15]从红树林根际土壤中获得一株枝孢属菌(Cladosporiumsp.)等。目前工业用产纤维素酶菌株主要为真菌,并多集中在木霉属菌株[16],其他高产纤维素酶真菌也具有很好的研究潜力。

本研究从树林腐殖质土壤中分离筛选出3株高产纤维素酶的菌株,以分离获得的3株菌株为研究对象,进行形态学鉴定和分子鉴定,为纤维素酶应用奠定一定的理论基础。

1 材料与方法

1.1 材料

1.1.1 试验样品

土壤取自自贡市附近树林腐烂树木和腐质土壤。

1.1.2 培养基

种子培养基[17]:羧甲基纤维素钠(CMC-Na) 10 g,蛋白胨3.0 g,KH2PO44.0 g,MgSO4·7H2O 0.3 g,溶于去离子水1 000 mL。

分离培养基[18]:CMC-Na 10 g,(NH4)2SO44.0 g,蛋白胨1.0 g,MgSO4·7H2O 0.5 g,KH2PO41.0 g,琼脂20 g,溶解至1 000 mL去离子水中。

液体产酶培养基[19](g):CMC-Na 10,蛋白胨3.0,酵母膏0.2,(NH4)2SO42.0,KH2PO44.0,MgSO4·7H2O 0.3 g, 溶于1 000 mL去离子水中。

秸秆培养基:油菜秸秆粉10 g,蛋白胨3.0 g,酵母膏0.2 g,(NH4)2SO42.0 g,KH2PO44.0 g,MgSO4·7H2O 0.3 g,去离子水1 000 mL。

1.1.3 试剂及药品

柠檬酸钠缓冲液(0.05mol/L,pH 4.8),羧甲基纤维素钠(CMC-Na)、蛋白胨、KH2PO4、MgSO4·7H2O、酵母膏、(NH4)2SO4等药品均为分析纯,购自成都市科龙化工试剂厂。

1.1.4 仪器与设备

MJ-250恒温培养箱、TG-16医用离心机,四川蜀科仪器有限公司;phs-3C酸度计、YX280A型高压蒸汽灭菌锅、SW-CJ-1F净化工作台、HH-6D数显恒温水浴锅,常州普天仪器制造;V-1000可见分光光度计,翱艺仪器有限公司;SKY-2102C恒温振荡器,上海苏坤实业有限公司。

1.2 试验方法

1.2.1 菌株分离和初筛

取10 g土壤样品,溶解于已灭菌的100 mL蒸馏水中,放入摇床28 ℃、180 r/min振荡30 min进行富集培养。取出静置10 min后在超净工作台内取上清液1 mL梯度稀释到10-1~10-6,吸取10-4、10-5、10-6各0.2 mL涂布于分离培养基上,每个浓度设置2个重复。28 ℃恒温培养箱中培养3 d,选择生长旺盛的菌株转接到分离培养基上进行划线培养,直到得到纯培养进行初筛[18]。

将得到纯培养的菌株以三点法用牙签点种到分离培养基上,恒温培养箱28 ℃培养3 d,用1 mg/mL 刚果红溶液倒入平板染色30 min,蒸馏水漂洗后用1 mol/L NaCl溶液脱色30 min,测定菌落直径与透明圈直径,筛选出直径比大的菌株进行复筛[19]。

1.2.2 菌株复筛

将菌株接种于种子培养基培养36 h,按5%接种量接种于发酵培养基中28 ℃、180 r/min培养3 d,先将菌液纱布过滤再8 000 r/min离心10 min,取上清液进行酶活测定。

羟甲基纤维素酶(CMC酶)活测定:在25 mL比色管中加入1.5 mL质量浓度为10 mg/mL的CMC溶液,再加入0.5 mL粗酶液,空白管不加酶液,在50 ℃ 下反应30 min,取出后加入1.5 mLDNS溶液,空白管加入0.5 mL 粗酶液迅速沸水浴10 min,冷却至室温后定容到25 mL,测定吸光值,计算酶活。

滤纸酶(FPA酶)活测定:将重50 mg的滤纸(长6 cm、宽1 cm)折成M形装入25 mL比色管中,加入1.5 mL pH为4.8的磷酸缓冲液,再加入0.5 mL粗酶液,空白管不加酶液,50 ℃下反应60 min,取出后加入1.5 mL DNS溶液,空白管加入0.5 mL粗酶液迅速沸水浴10 min,冷却至室温后定容到25 mL,测定吸光值,计算酶活。酶活定义:在一定条件下,1 mL 粗酶液每分钟水解底物产生1 μg葡萄糖所需酶量定义为1个酶活单位(U)。

1.2.3 菌种鉴定

形态学鉴定:将菌株在CMC培养基上划线培养3 d后观察菌落形态特征,挑取少量菌体涂于载玻片在显微镜下观察菌株的形态特征。

分子鉴定:将菌株在种子培养基中液体培养36 h, 使用真菌DNA提取试剂盒进行DNA提取。将提取得到的DNA作为模板,用真菌18S rDNA通用引物ITS1:(5’-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3’),ITS2:(5’-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3’)进行PCR扩增。

PCR反应体系为50 μL:I5Mix 25 μL,上下游引物各1 μL,DNA模板1 μL,dH2O 22 μL。PCR反应条件:预变性温度94 ℃,5 min;变性:98 ℃,10 s;退火:53 ℃,15 s;延伸:72 ℃,10 s;循环数:35;总延伸:72 ℃, 5 min;4 ℃保持。

将PCR扩增产物送至成都擎科梓熙生物技术有限公司进行测序,测序结果上传至NCBI进行序列同源性比对,选择同源性高的序列用MEGA 6.0软件构建菌株系统发育树,鉴定菌株种属。

1.2.4 菌株利用秸秆产酶及秸秆降解率

将菌株培养好的种子液接种到秸秆培养基中,在28 ℃、180r/min条件下摇床培养3 d,然后测定CMC、FPA酶活。同时在培养的第3天、第6天时测定秸秆降解率。测定方法为使用滤纸过滤发酵液,将滤渣在烘箱内80 ℃烘干至恒重,用失重法计算油菜秸秆失重率[20]。

2 结果与分析

2.1 产纤维素酶菌株的分离与初筛

将样品土壤稀释液涂布于以CMC-Na为唯一碳源的分离培养基培养,一共分离纯化出23株菌株,通过进一步点种于分离培养基,刚果红染色后测定透明圈直径与菌落比,筛选出8株透明圈菌落比值较大的菌株,其中菌株B03透明圈与菌落直径比最大达到2.53±0.23(图1),详见表1。

图1 菌株B03刚果红染色的透明圈Fig.1 Transparent hydrolysis circle by Congo red staining of strain B03

2.2 菌株酶活测定

将分离得到的透明圈与菌落直径比较大的菌株接种到种子培养基,180 r/min、28 ℃培养2 d后以5%的接种量接种到发酵培养基中,180 r/min、28 ℃条件下发酵3 d后取发酵液纱布过滤后于8 000 r/min条件下离心10 min得上清液测定酶活。结果显示,菌株B03的CMC酶活最高,达到(427.62±2.78)U/mL,FPA酶活也较高为(46.83±1.85)U/mL。菌株D11、E15 CMC酶活力也较高,将此3株菌作为后续研究对象。结果详见表1。

表1 菌株透明圈与菌落直径比和酶活Table 1 The diameter ratios of the transparent ring to the colony and enzyme activity

2.3 产纤维素酶菌株的鉴定

2.3.1 形态学鉴定

将菌株B03、D11和E15于CMC分离培养基上28 ℃条件下培养4 d后,观察菌株菌落形态。结果表明,3株菌的菌落形态相似,颜色均为灰绿色,菌落平铺状表面有绒毛状菌丝,为圆形或椭圆形。显微镜下3株菌株形态也相似,分身孢子梗端生或者侧生于菌丝,孢子梗直长少有弯曲,在其顶端产生孢子链,分身孢子为卵圆形(图2)。根据《中国真菌志》,菌株B03、D11和E15依据形态学特征初步鉴定为枝孢属(Cladosporiumsp.)。

图2 菌株形态特征Fig.2 Morphological characteristic of strain

2.3.2 分子鉴定

利用试剂盒提取获得的3株菌株基因组DNA,以提取得到的DNA为模板进行PCR扩增,将扩增产物送至成都擎科梓熙生物技术有限公司进行18S rDNA测序,将测序结果与NCBI上与已有微生物18S rDNA序列进行Blast分析,结果表明3株菌株与枝孢菌属有较高的同源性,达99%。选择与菌株同源性较高的菌株下载其18S rDNA基因序列,使用MEGA6.0构建系统发育树,最终鉴定筛选所得菌株B03、E15为枝孢菌(Cladosporiumsp.),D11为极细枝孢菌(Cladosporiumtenuissimum),如图3、图4所示。

图3 菌株电泳图Fig.3 The DNA and PCR fragments of strains

图4 菌株的18S rDNA系统发育树Fig.4 Phylogenetic tree of strains based on the 18S rDNA sequence

2.4 菌株利用秸秆产酶及秸秆降解率

将菌株在以油菜秸秆为唯一碳源的液体培养基中培养3 d,然后滤纸过滤取滤液,8 000 r/min离心10 min得粗酶液,按照1.2.2中方法测定CMC、FPA酶活。在同样培养条件下分别培养了3、6 d的发酵过滤残渣,在80 ℃下烘干至恒重,以失重法计算油菜秸秆的降解率。由表2可知,3株菌株以油菜秸秆为底物发酵产酶能力比以CMC为底物时低,可能是由于油菜秸秆成分复杂,菌株不能完全利用其所有成分物质,导致产酶能力有一定降低,但酶活力依然保持较高。培养6 d后秸秆降解率均达到20%及以上,B03达26.80%,对油菜秸秆粉均有较好的降解效果。

表2 菌株酶活力和秸秆降解率Table 2 Enzyme activity and the degradation rate of straw of strains

3 讨论

土壤中富含大量微生物,包括细菌、真菌、放线菌等,腐殖土中含有较多木质纤维素,是自然富集产纤维素酶菌株的地方。目前关于产纤维素酶真菌的研究多集中于木霉属(Trichoderma)、曲霉属(Aspergillus)、青霉属(Penicillium)等,关于枝孢菌属(Cladosporiumsp.)产纤维素酶的报道较少[16]。枝孢菌在自然界中分布广泛,具有耐压、耐热等生理特性[21],大多数已知的枝孢菌的模式菌为植物寄生或腐生菌,枝孢菌的生活方式决定了其具有分解木质纤维素的能力[22]。

本研究从腐质土壤样品中,利用刚果红染色初筛、酶活复筛筛选获得3株高产纤维素酶真菌,通过显微镜形态特征观察及分子生物学鉴定,该3株菌均属于枝孢菌属。3株菌中B03菌株以CMC为底物产酶CMC酶活达(427.62±2.78)U/mL,FPA酶活为(46.83±1.85)U/mL,其CMC酶活显著高于田云等[13]、陈丽燕等[23]报道的菌株。在以油菜秸秆为底物产酶时CMC酶活也有(352.50±4.17)U/mL,FPA酶活为(35.67±1.85)U/mL,以油菜秸秆粉为底物时产酶能力虽不如以CMC为底物时高,但其CMC酶活还是具有较高酶活,高于柴秀娟等[17]报道的酶活。在培养6 d后油菜秸秆降解率达26.8%,因测定时有菌体生长影响,故实际分解率应大于测定值。据报道,枝孢菌还有产木质素酶的能力[24],后续还可研究其木质素酶能力。

综上本研究获得高产纤维素酶真菌是1株高产CMC酶的枝孢菌,所产CMC酶活力较高,同时也能以油菜秸秆为底物产酶,对油菜秸秆具有较好的分解率,是1株具有较高研究价值的菌株。

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