2018年10月24日，科技部网站上发布了6份行政处罚决定书，涉及5家公司和1家医院。这其中涉及3家上市公司，包括华大基因外控股子公司。行政处罚决定书显示，中国人类遗传资源管理办公室对深圳华大基因科技服务有限公司（下称“华大科技”）执行“中国女性单相抑郁症的大样本病例对照研究”国际科研合作情况进行了调查，发现华大科技与华山医院未经许可与英国牛津大学开展中国人类遗传资源国际合作研究，华大科技未经许可将部分人类遗传资源信息从网上传递出境。

而有不少自媒体借科技部公布的一批处罚企业信息，炮制了“华大基因将14万孕妇基因組流出国外”的新闻，一时间引发部分民众恐慌。之后华大基因发布《澄清公告》，表示这是某些自媒体张冠李戴，错将2015年的“科技部国科罚”与华大研究团队在2018年10月的一项“14万中国人基因大数据”研究刻意关联，并捏造传播数据外流境外的谣言。

对此，华大基因于2018年10月26日下午火速回应称，“14万中国人基因大数据”研究严格遵从《人类遗传资源管理暂行办法》和生命伦理原则规范。关于数据安全性问题，本次研究全部在境内完成，样本及数据全部保留在深圳国家基因库，不存在任何遗传资源数据出境的情况，这也得到了世界著名学术期刊《Cell》的认同。

据了解，“中国女性单相抑郁症的大样本病例对照研究”指的是2011年华大基因为华山医院进行样本基因组学分析，通过病例对照研究揭示抑郁症致病机理。其中，华大科技是作为一个科技服务方，而并非项目申报方，并未参与到任何接触到原始数据的分析工作。虽然华大科技没有违法的故意，但华大基因确实有对项目合作方审核不严的疏忽过失。

值得注意的是，此次华大基因被质疑事件也引发了人们对整个基因市场的担忧。基因含有人体大量信息，被称为人类的“生命说明书”。而这些基因隐私一旦公开，可能会给一个人的工作、升学、医疗、生活乃至生存造成不良后果，甚至导致基因歧视，因此，基因隐私的保护成为了一个重要的话题。

目前，美国每年平均做500多万人次的基因检测，创造30亿美元的产值，欧洲及其他发达国家和地区的基因检测工作也在迅速升温。而中国的基因检测基本上与发达国家同步，预计将形成100亿元的市场容量。随着基因技术逐渐实现商业化，基因领域的企业都争相夺取大数据资源，如何在确保安全的前提下合理应用成为关键。