孔德康,李 艺,王红旗*,许 洁,关晶晶



红球菌跨膜运输荧蒽的差异膜蛋白分析

孔德康1,李 艺2*,王红旗1*,许 洁1,关晶晶1

(1.北京师范大学水科学研究院,北京 100875；2.广西师范大学环境与资源学院,广西 桂林 541004)

提取不同时间荧蒽诱导下红球菌BAP-1分泌的膜蛋白,利用同位素标记相对和绝对定量技术(iTRAQ技术)结合液相二级质谱对差异膜蛋白进行聚类以及生物信息学分析.旨在从蛋白质层面上研究红球菌BAP-1跨膜运输荧蒽过程中起关键作用的膜蛋白种类及其作用机制.结果共鉴定到172个差异膜蛋白.通过差异膜蛋白的COG和GO功能分析,发现荧蒽的加入主要影响了红球菌BAP-1细胞膜上与能量、转运相关的膜蛋白.ABC转运蛋白和TonB依赖转运蛋白作为微生物主要的载体蛋白对BAP-1跨膜运输荧蒽起到了重要作用.过氧化氢酶和超氧化物歧化酶在第6d有一个显著上调,作为抗氧化防御机制来保护微生物.各种膜蛋白在不同阶段发挥着各自作用,这些蛋白共同组成蛋白互作网络调控红球菌BAP-1的跨膜运输过程.

红球菌BAP-1；荧蒽；膜蛋白；跨膜运输；iTRAQ

多环芳烃(PAHs)因为其“三致”效应以及稳定的化学性质对人类和生态环境造成了极大的影响.PAHs的水溶性差,通过自然衰减或者物理化学去除工艺的方法往往收效甚微.生物降解已经被证实是最经济、最环保的PAHs修复方法[1].红球菌是一种典型的PAHs降解菌,可以有效的降解萘、菲、荧蒽等PAHs[2-3].

细胞膜是防止细胞外物质自由进入细胞的屏障,是保证细胞内……