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一株产α-淀粉酶芽孢杆菌的分离与鉴定

2019-01-17玄阳

山东化工 2018年24期
关键词:蜡样淀粉酶芽孢

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(1.南阳理工学院 生物与化学工程学院,河南 南阳 473004;2.河南省工业微生物资源与发酵技术重点实验室,河南 南阳 473004)

淀粉酶是催化水解淀粉和糖原的一类酶,是实现工业化生产最早的酶制剂品种,也是迄今为止用途最为广泛、产量最大的酶制剂品种[1]。淀粉酶包括α-淀粉酶、β-淀粉酶、葡萄糖淀粉酶和异淀粉酶,不同的淀粉酶有不同的作用方式[2]。α-淀粉酶广泛存在于主要分布在动植物和微生物中,其中微生物来源的淀粉酶占绝大部分,目前报道产生α-淀粉酶的微生物有米曲霉(Aspergillusoryzae)[3]、米根霉(Rhizopusoryzae)[4]芽孢杆菌(Bacillus)[5-8]等。本研究从土壤中分离到一株产α-淀粉酶活力较高的菌株Y1,经形态学及16SrDNA鉴定其为蜡样芽孢杆菌(B.cereus),并对其酶活进行了初步研究。

1 材料与方法

1.1 材料

1.1.1 土壤样品

土样取自南阳理工学院校园开水房附近土壤,食堂附近土壤,校园操场草地土壤,荷花池附近土壤,树林间土壤等共计10份土样。除去表层浮土,10~30cm处取样,取回后立即对土样进行分离。

1.1.2 主要试剂与仪器

试剂:可溶性淀粉、酵母粉、蛋白胨、琼脂粉等均为生物纯,北京奥博星;葡萄糖、碘化钾、I2、 MgSO4·7H2O、 KH2PO4等均为分析纯,天津科密欧;细菌DNA基因组提取试剂盒DP302,北京天根;PCR及电泳所用试剂均购自生工生物工程(上海)股份有限公司。

仪器:上海一恒LRH-250生化培养箱;常州国华HH-3A控温水浴锅;上海安亭飞鸽TGL-16G高速台式离心机;德国艾本德Eppendorf 5430R高速冷冻离心机 ;上海申安LDZX-50KBS高压灭菌锅;奥林巴斯CX31三目显微镜;BioDrop超微量紫外可见分光光度计;德国艾本德Eppendorf Mastercycler PCR仪;北京六一DYY-7C电泳仪;北京六一DYCP-31DN琼脂糖水平电泳槽;北京君意东方JY04S-3E凝胶成像分析仪。

1.1.3 培养基

富集培养基(g/L):1.2%可溶性淀粉、0.8%蛋白胨、0.2%酵母粉、0.05%MgSO4·7H2O、0.1%KH2PO4。筛选与斜面保藏培养基(g/L): 1.2%可溶性淀粉、0.8%蛋白胨、0.2%酵母粉、0.05% MgSO4·7H2O、0.1%KH2PO4、1.5%琼脂。发酵培养基: 1.5%可溶性淀粉、1.0%蛋白胨、0.5%酵母粉、0.05%MgSO4·7H2O、0.1%KH2PO4。以上培养基配制完成后调整pH值至7.0后高压蒸汽灭菌,121℃,20min。

1.2 方法

1.2.1 样品处理

准确称取每份土壤样品5g,放入有100mL的富集培养基和小玻璃珠的250mL三角瓶中,震荡至土壤分散均匀后置于恒温摇床37℃,180r/min富集培养48h。将富集完成后的发酵液用无菌生理盐水进行梯度稀释,得到10-1~10-6稀释度的稀释液,用移液器依次吸取10-1~10-4样品稀释液各200μL至淀粉筛选培养基上,用涂布器将稀释液在平板上涂布均匀。将涂布完成的平板平放于桌20~30min至液体完全吸收后转入37℃恒温培养箱倒置培养。

1.2.2 产淀粉酶菌株筛选

37℃培养48h后,对各个稀释度涂布平板进行观察,对单一菌落较多的平板用卢戈氏碘液进行染色,选择有较大透明圈的菌落利用划线分离法进行二次纯化;二次纯化后观察平板上菌落是否单一,再次进行染色验证,挑取仍产生透明圈的单菌落接种至斜面上保存。

1.2.3 产淀粉酶菌株鉴定

首先对保藏菌株进行菌落形态观察,并对其进行革兰氏染色镜检形态观察,然后利用天根细菌基因组提取试剂盒提取其基因组DNA,在BioDrop超微量紫外可见分光光度计于260nm处测定其浓度,用琼脂糖凝胶电泳检测其完好程度。取纯化后质量合格的DNA作为模板进行16SrDNA的扩增,引物为27F: 5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3';1492R:5'-GGTTACCTTGTTACGACTT-3';反应条件为:预变性 94℃,5min;变性 94℃ 30s,退火 55℃ 1min,延伸72℃ 1min,30循环,最终延伸72℃ 10min。反应体系为:2×Taq PCR Master Mix(with Blue Dye)25μL, DNA模板1μL,正反向引物各1μL ,补足无菌去离子水至50μL。将PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳检测并切胶回收后送上海生工(生物)进行测序,测序完成后将序列在https://www.ezbiocloud.net/数据库中进行16SrDNA相似性比较分析。

1.2.4 酶活测定

粗酶液液制备:挑取保存至斜面上的纯培养物接种至发酵培养基,37℃摇床培养48h后于4℃,6000rpm离心取上清进行酶活测定。

酶活测定[9]:采用碘比色改良法对粗酶液进行酶活测定。具体做法如下:取5mL 0.5%的可溶性淀粉溶液于40℃水浴中预热10min后加入稀释适当倍数的酶液0.5mL,反应5min后加入5mL 0.1mol/L H2SO4终止反应。取0.5 mL反应液与5mL碘液显色后于620nm处测定吸光值。用0.5mL水代替0.5mL反应液为空白,以不加酶液的反应管为对照。酶活力单位定义:40℃下,5分钟内水解1mg淀粉的酶量为一个活力单位。酶活力(U/mL)=(R0-R)/R0×50×D

R0:对照吸光值; R:反应液吸光值;D:酶液稀释倍数(调整D使(R0-R)/R0在0.2~0.7之间)

2 结果与分析

2.1 菌株筛选及鉴定

2.1.1 菌株形态学鉴定

初筛平板于37℃培养24~48h(根据其上单菌落长出情况)后用卢戈氏碘液染色,若菌落周围有明显水解圈,说明该菌可产生胞外淀粉酶。其中水解圈较大的菌落呈白色,中间凸起,干燥,菌落周围呈锯齿状,将该菌株命名为Y1,对其进行革兰氏染色紫色,为革兰氏阳性菌,呈长杆状,有明显芽孢,Y1菌落形态及镜检形态见图1。

图1 A为Y1在淀粉平板上产生的透明水解圈;B为镜检形态(100×)

2.1.2 PCR产物扩增电泳分析

图2 菌株Y116SrDNA PCR扩增产物电泳图 (泳道1为样品;泳道2为DL2000 Maker)

将菌株Y1的16SrDNA产物于1%的琼脂糖进行凝胶电泳分析,菌株Y1的16SrDNA产物条带单一,约1.5kb,与预期大小一致。

2.1.3 16SrDNA分子生物学鉴定

菌株Y1 16SrDNA基因序列测序所获得序列长度为1501bp,将其与https://www.ezbiocloud.net/数据库中的序列进行同源性比对,发现Y1与芽孢杆菌属的16SrDNA基因序列自然聚类,将Y1的16SrDNA基因序列与9条相似性较高的序列利用MEGA7.0按照邻接法(Neighbor-Joining )构建系统发育树见图3,从图中可看出Y1 与BacilluscereusATCC 14579 AE016877聚为一群,表明Y1与BacilluscereusATCC 14579 AE016877的亲缘关系最近,结合其形态学特征,初步鉴定Y1为蜡样芽孢杆菌。

图3 基于16SrRNA基因序列相似性的菌株Y1与9株细菌的系统进化树

2.2 Y1酶活测定

Y1菌株粗酶液的酶活为140U/mL, 与文献中其他报道的产淀粉酶蜡样芽孢杆菌相比酶活一般,可能是酶活测定的方法不同使然。目前淀粉酶测定方法主要有碘比色改良法[9]、3,5-二硝基水杨酸法[10]等,以上两种方法均可测定α-淀粉酶酶活,本研究中采用的是碘比色改良法,该方法较为简便灵敏,但测定时碘液需现配现用,且待测酶液需稀释至一定浓度,使其吸光值处于线性范围内。师永生等[11]从废弃的淀粉堆中筛选到一株产低温淀粉酶的蜡样芽孢杆菌(B.cereus)GXBC-1,从中克隆到一个淀粉酶基因并在大肠杆菌中进行重组表达,该重组酶最适温度为35℃,在20℃仍具有53%的活力;最适pH值为7.0,Km值为0.72 mg/mL。任平等[12]等从畜禽动物胃肠道中可产淀粉酶、蛋白酶的蜡样芽孢杆菌(B.cereus)J2、J14。王磊等[13]从土壤中筛选出4株产淀粉酶芽孢杆菌,其中1株为枯草芽孢杆菌,3株为蜡样芽孢杆菌,利用3,5-二硝基水杨酸比色法测定其酶活,其中地衣芽孢杆菌Bacillus3的酶活最高,为8.4U/mL。

3 讨论

土壤是微生物种类最丰富的生境之一,本研究从10个土壤样品中仅分离到一株产α-淀粉酶菌株Y1,可能是样品处理过程前未进行富集培养,也可能是培养基较为单一,而芽孢杆菌的对环境适应性耐受性强,容易筛选。目前已报道的产淀粉酶的芽孢杆菌主要有枯草芽孢杆菌(B.subtilis)[14]、解淀粉芽孢杆菌(B.amyloliquefaciens)[15]、地衣芽孢杆菌(B.lincheniformis)[16]等,分离生境较为丰富,包括土壤[5,13]、海洋[17]、动物肠道[12]等;其中部分菌株除了可产胞外淀粉酶外,还可以产蛋白酶、纤维素酶、脂肪酶等,可在食品、饲料、生物防治等领域进行应用。本研究中筛选到的菌株Y1为蜡样芽孢杆菌,仅对其进行了鉴定和酶活初探,在今后工作中将对其发酵条件和酶学性质进行深入研究,以期为该酶的开发应用提供理论依据。

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